| 甘蔗PIN-LIKES基因家族的鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 潘洁明,田绍锐,梁艳兰,朱宇林,周定港,阙友雄,凌辉,黄宁.甘蔗PIN-LIKES基因家族的鉴定与表达分析[J].作物学报,2023(2):414-425. |
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| 作者姓名： | 潘洁明 田绍锐 梁艳兰 朱宇林 周定港 阙友雄 凌辉 黄宁 |
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| 作者单位： | 1. 玉林师范学院农学院;2. 西南大学植物保护学院;3. 福建农林大学/农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室;4. 湖南科技大学生命科学学院/经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室 |
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| 摘 要： | PILS (PIN-LIKES)是一类新发现的生长素输出载体,协助生长素的极性运输。本研究立足甘蔗割手密基因组和栽培品种转录组数据,利用生物信息学分析技术,分别在割手密和栽培品种中鉴定到11个PILS(Saccharum spontaneum PIN-LIKES, SsPILS)基因和4个PILS (Saccharum spp. hybrid PIN-LIKES, ScPILS)基因。结果表明, 11个SsPILS基因家族成员分布于6条染色体上,基因内含子数量介于5～11个。系统进化树分析发现,割手密PILS与水稻PILS有较高同源性,归属于3个不同的系统发育分支。转录组数据分析显示, SsPILS1c的同源基因ScPILS1c在受高粱花叶病毒和黑穗病菌胁迫甘蔗栽培种中差异表达。通过RT-PCR扩增技术,克隆获得ScPILS1c基因序列(NCBI accession number:OM258732)。该基因全长cDNA为1332 bp,包含一个1233 bp的完整开放阅读框,编码410个氨基酸,理论等电点(pI)为6.17,不稳定系数为39.31,平均疏水性值为0.689,预测ScPI...
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| 关 键 词： | 甘蔗 PILS 生物信息学 实时荧光定量PCR 基因家族 |
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