| 日本沼虾体重和出肉率联合GWAS分析 |
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| 引用本文： | 刘帅,蒋丽.日本沼虾体重和出肉率联合GWAS分析[J].安徽农业科学,2023(2):108-110+114. |
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| 作者姓名： | 刘帅 蒋丽 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心;2. 中国水产科学研究院农业农村部水生动物基因组学重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2018YFD0901303)； |
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| 摘 要： | 目的]定位筛选影响日本沼虾体重及出肉率性状的候选基因。方法]收集成熟期且表现健康的日本沼虾，记录体重、出肉率，提取DNA进行测序并进行基因分型，获得单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphisms, SNP)标记数据，利用多性状联合的全基因关联分析(Genome-wide association study, GWAS)方法检验与体重、出肉率性状存在显著相关的SNP位点，根据SNP的物理信息实现候选功能基因的筛选和定位。结果]联合分析共定位到6个SNP位点，检测效率远高于单一分析的1个SNP,根据6个显著位点共定位到5个候选功能基因，除1个功能未知的新基因外，剩余4个基因都与机体代谢、发育相关。结论]完成了日本沼虾体重、出肉率性状相关基因的定位，可为日本沼虾生长代谢的基因组水平揭示提供理论基础，也可为日本沼虾的其他数量性状研究提供思路。
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| 关 键 词： | 日本沼虾 全基因组关联分析 体重 出肉率 |
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