| 玉米株高和穗位高性状全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 马雅杰,鲍建喜,高悦欣,李雅楠,秦文萱,王彦博,龙艳,李金萍,董振营,万向元.玉米株高和穗位高性状全基因组关联分析[J].作物学报,2023(3):647-661. |
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| 作者姓名： | 马雅杰 鲍建喜 高悦欣 李雅楠 秦文萱 王彦博 龙艳 李金萍 董振营 万向元 |
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| 作者单位： | 1. 北京科技大学生物与农业研究中心/化学与生物工程学院/顺德研究生院/北京中智生物农业国际研究院 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目“农业生物种质资源挖掘与创新利用”重点专项(2021YFD1200700)资助~~； |
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| 摘 要： | 适宜的株高和穗位高可提高植株的养分利用效率及抗倒伏性,对玉米增产和稳产具有重要意义。为揭示玉米株高和穗位高遗传机制,本研究以854份玉米自交系为关联群体,利用均匀分布于玉米10条染色体的2795个SNP标记对4个环境下玉米株高、穗位高以及穗位系数进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。共定位到81个显著关联SNP位点(P<0.0001),其中与株高显著关联的SNP为35个,单个位点表型解释率为0.02%～6.23%;与穗位高显著关联SNP为31个,单个位点表型变异解释率为0.03%～3.06%;与穗位系数显著关联的SNP位点为24个,单个位点表型变异解释率为0.03%～6.64%。进一步鉴定出15个可在2个及以上环境共定位的稳定SNP,其中6个为本研究首次发现, 9个位于前人定位QTL区间或/和关联SNP位点2 Mb范围内。在15个稳定SNP位点上下游各200kb的置信区间共发现83个功能注释基因,结合文献分析筛选出了每个位点最有可能的候选基因,这些候选基因主要参与激素合成与信号转导、糖类代谢、细胞分裂调控等途径。鉴定出6个...
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| 关 键 词： | 玉米 株高 穗位高 全基因组关联分析 候选基因 |
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