甘蔗ScbHLH13基因的RT-PCR克隆与功能分析 |
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引用本文: | 莫广玲,余陈静,梁艳兰,周定港,罗俊,王莫,阙友雄,黄宁,凌辉.甘蔗ScbHLH13基因的RT-PCR克隆与功能分析[J].作物学报,2023(9):2485-2497. |
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作者姓名: | 莫广玲 余陈静 梁艳兰 周定港 罗俊 王莫 阙友雄 黄宁 凌辉 |
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作者单位: | 1. 福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心/福建农林大学生命科学学院;2. 贵阳市教育科学研究所;3. 湖南科技大学生命科学学院/经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室;4. 玉林师范学院农学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31901592,32160435); |
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摘 要: | bHLH转录因子是植物体内重要的调节因子,对植物的生长发育、次生代谢以及花青素生物合成等方面具有调节作用。本研究以高粱bHLH13(XM_002440799.2)为探针序列,从甘蔗中通过RT-PCR克隆获得一个ScbHLH13基因,并对其在不同胁迫响应转录组数据中进行表达模式分析,同时对该基因及其所编码蛋白进行了理化性质预测以及系统进化、原生质体亚细胞定位和实时荧光定量PCR表达量分析。结果显示,ScbHLH13所编码蛋白包含586个氨基酸残基,以无规则卷曲和α螺旋为主,亲水且不稳定,呈弱碱性;具有典型核定位信号,无跨膜结构;其序列内包括bHLH-MYC、HLH 2个典型保守结构域,属于bHLH超家族成员。在系统进化中ScbHLH13属于Ⅲ (d+e)类组,与高粱亲缘关系最近。在转录组数据中, ScbHLH13的表达在甘蔗品种ROC22上受低氮胁迫和黑穗病菌侵染抑制,轻微受高粱花叶病毒侵染诱导;而在Badila受低氮、在YC05-179受甘蔗黑穗病菌侵染诱导。亚细胞定位结果显示,在烟草表皮细胞中瞬时表达ScbHLH13定位于细胞核和细胞膜,在甘蔗原生质体瞬时表达ScbHLH13则定位于...
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关 键 词: | 甘蔗 原生质体 bHLH转录因子 ScbHLH13基因 |
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