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基于SNPs标记的部分栽培稻品种遗传结构分析
引用本文:高月,姜树坤,钟鸣,马慧,郭志富,陈丽静,李浩戈,徐正进.基于SNPs标记的部分栽培稻品种遗传结构分析[J].华北农学报,2012(4):65-72.
作者姓名:高月  姜树坤  钟鸣  马慧  郭志富  陈丽静  李浩戈  徐正进
作者单位:沈阳农业大学,辽宁省农业生物技术重点实验室;黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所;辽宁省北方粳稻育种重点实验室
基金项目:“十二五”国家科技支撑计划(2011BAD35B02-01);国家自然科学基金(30971845);辽宁省农业生物技术重点实验室专项资金
摘    要:利用分布于水稻12条染色体上的190个SNPs位点,对97个水稻品种进行了遗传多样性和遗传结构分析。结果表明,190个SNPs位点中有92个具有多态性,多态性比率为48.42%。品种间的遗传相似系数(GS)变化范围在0.34~1.00之间,平均GS为0.87。贝叶斯聚类和UPGMA法聚类的结果相似,均将供试材料分成籼、粳2个亚种,且品种间的亲缘关系与地理来源关系不大。通过SNPs标记的遗传多样性分析结果表明,供试材料在亚种内的亲缘关系较近、遗传基础狭窄,部分供试品种具有相似的遗传背景。

关 键 词:SNPs标记  水稻品种  遗传结构  遗传多样性

Genetic Structure Revealed by Single-nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Some Diverse Accessions of Cultivated Rice (Oryza sativa L.)
GAO Yue,JIANG Shu-kun,ZHONG Ming,MA Hui,GUO Zhi-fu,CHEN Li-jing,LI Hao-ge,XU Zheng-jin.Genetic Structure Revealed by Single-nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Some Diverse Accessions of Cultivated Rice (Oryza sativa L.)[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2012(4):65-72.
Authors:GAO Yue  JIANG Shu-kun  ZHONG Ming  MA Hui  GUO Zhi-fu  CHEN Li-jing  LI Hao-ge  XU Zheng-jin
Institution:1.Key Laboratory of Agricultural Biotechnology of Liaoning Province,Shenyang Agricultural University, Shenyang 110161,China;2.Key Laboratory of Rice Breeding of Liaoning Province,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110161,China;3.Cultivation and Farming Research Institute,Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150086,China)
Abstract:
Keywords:
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