首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

茶树SRO基因家族的鉴定及表达分析
引用本文:郭永春,王鹏杰,陈笛,郑玉成,陈雪津,叶乃兴.茶树SRO基因家族的鉴定及表达分析[J].茶叶科学,2019,39(4):392-402.
作者姓名:郭永春  王鹏杰  陈笛  郑玉成  陈雪津  叶乃兴
作者单位:福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州,350002;福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州,350002;福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州,350002;福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州,350002;福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州,350002;福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州,350002
基金项目:福建省“2011协同创新中心”中国乌龙茶产业协同创新中心专项(闽教科〔2015〕75号)、国家现代农业(茶叶)产业技术体系建设专项资金项目(CARS-19)、福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2016117、CXZX2017181)
摘    要:SROs(Similar to rcd one)是植物特有的基因家族。本研究利用生物信息学方法从茶树基因组中鉴定获得9个茶树SRO基因家族成员,分别命名为CsRCD1-4和CsSRO1-5。9个茶树SRO基因的编码蛋白均具有特征结构域PARP和RST,具有相似的保守基序。系统进化树分析聚分为3组,Ι组包含CsRCD1-4,Ⅱ组包含CsSRO1和CsSRO2,Ⅲ组包含CsSRO3-5。基因结构分析表明每个CsSRO基因含有4至9个外显子。8个茶树组织转录组数据分析表明,CsRCD1、CsRCD3和CsRCD4可能在茶树不同发育阶段具有重要作用;大多数CsSRO基因在根和成熟叶中较高表达。上游启动子区域分析发现大量与植物发育、激素及胁迫响应密切相关的顺式作用元件,进一步对CsSRO基因在干旱和脱落酸处理下的表达模式进行分析发现,9个CsSRO基因均被诱导表达,CsSRO基因可能与茶树抗旱密切相关。

关 键 词:茶树  SRO  系统进化  干旱胁迫
收稿时间:2019-02-11

Genome-wide Identification and Expression Analysis of SRO Gene Family in Camellia sinensis
GUO Yongchun,WANG Pengjie,CHEN Di,ZHENG Yucheng,CHEN Xuejin,YE Naixing.Genome-wide Identification and Expression Analysis of SRO Gene Family in Camellia sinensis[J].Journal of Tea Science,2019,39(4):392-402.
Authors:GUO Yongchun  WANG Pengjie  CHEN Di  ZHENG Yucheng  CHEN Xuejin  YE Naixing
Institution:College of Horticulture, Fujian Agriculture and Forestry University/Key Laboratory of Tea Science at Universities in Fujian, Fuzhou 350002, China
Abstract:
Keywords:Camellia sinensis   SRO  phylogeny analysis  stress  
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
点击此处可从《茶叶科学》浏览原始摘要信息
点击此处可从《茶叶科学》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号