| 凡纳滨对虾全基因组SSR标记开发及不同养殖群体的遗传多样性 |
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| 引用本文： | 王佳佳,王琼,秦桢,陈耀辉,李健,李吉涛.凡纳滨对虾全基因组SSR标记开发及不同养殖群体的遗传多样性[J].水产学报,2023,47(6):069606-069606. |
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| 作者姓名： | 王佳佳 王琼 秦桢 陈耀辉 李健 李吉涛 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
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| 基金项目： | 国家虾蟹产业技术体系专项 (CARS-48)；中国水产科学研究院基本科研业务费专项 (2021GH05，2020TD46) |
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| 摘 要： | 为了探究SSR标记对凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构的影响，为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。实验利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记，基于POPGENE 1.32、PIC-CALC和Mega 6.0软件分析6个不同来源的凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体结构特征。在凡纳滨对虾全基因组数据中共鉴定出10 453 975个微卫星，约占基因组序列总长度的18.56%，其中，二碱基微卫星最丰富，占总数的82.15%。利用具有多态性的14个SSR标记分析3个国内群体桂海1号(CG)、海兴农2号(CH)和山东养殖群体(CT)]，及3个国外群体厄瓜多尔1号(FO)、厄瓜多尔2号(FT)和墨西哥群体(FM)]的遗传特征。结果显示，14个SSR标记在6个群体中共检测到208个等位基因变异，等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态性信息含量的范围分别为6～25、0.112～0.994、0.234～0.925和0.226～0.918；遗传多样性丰富程度为CH>FO>FM>CT>FT>...
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| 关 键 词： | 凡纳滨对虾 养殖群体 遗传多样性 基因组 微卫星标记 |
| 收稿时间： | 2021/6/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/10/20 0:00:00 |
Development of SSR markers from genomic data for Litopenaeus vannamei and analysis of genetic diversity in different cultured populations |
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| WANG Jiaji,WANG Qiong,QIN Zhen,CHEN Yaohui,LI Jian,LI Jitao.Development of SSR markers from genomic data for Litopenaeus vannamei and analysis of genetic diversity in different cultured populations[J].Journal of Fisheries of China,2023,47(6):069606-069606. |
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| Authors: | WANG Jiaji WANG Qiong QIN Zhen CHEN Yaohui LI Jian LI Jitao |
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| Institution: | Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences,,,,,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Litopenaeus vannamei Culture population Genetic diversity Genomic Microsatellite markers |
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