| 植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体的预测方法对比研究 |
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| 引用本文： | 韩长志,薄淑文.植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体的预测方法对比研究[J].福建农林大学学报(自然科学版),2023(5):607-616. |
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| 作者姓名： | 韩长志 薄淑文 |
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| 作者单位： | 1. 西南林业大学生物多样性保护学院;2. 云南省森林灾害预警与控制重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31960314)； |
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| 摘 要： | 植物病原丝状真菌G蛋白偶联受体(GPCR)在实现外界信号感知和传递过程中发挥着重要作用。基于GPCR蛋白所具有的典型7个跨膜保守结构域及非典型保守结构域，通过总结前人已报道的候选GPCR的同源比对方法，对其跨膜结构域数量预测方法及跨膜结构蛋白数据库进行对比，明确TOPCONS是目前预测GPCR跨膜结构域的较好方法。然后，选择NCBI数据库中223个不同真菌的GPCR蛋白序列通过TOPCONS和TMHMM进行对比分析，结果显示，2种软件对GPCR跨膜结构域数量的预测结果不尽相同，TOPCONS预测结果的准确度较高；进一步对上述GPCR蛋白序列的氨基酸数目进行分析，明确具有7个跨膜结构域的GPCR蛋白氨基酸数目为200～1 406个。该研究可为进一步开展植物病原丝状真菌GPCR蛋白的结构预测及其功能研究提供参考。
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| 关 键 词： | 植物病原丝状真菌 G蛋白偶联受体 预测方法 TOPCONS软件 对比分析 |
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