| 15种蔷薇属matK基因的密码子偏好性分析 |
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| 引用本文： | 黄长兵,沈萍,侯哲.15种蔷薇属matK基因的密码子偏好性分析[J].福建农林大学学报(自然科学版),2023(4):466-472. |
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| 作者姓名： | 黄长兵 沈萍 侯哲 |
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| 作者单位： | 苏州农业职业技术学院 |
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| 基金项目： | 四川省自然科学基金项目(2022NSFSC1141)； |
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| 摘 要： | 基于15种蔷薇属叶绿体全基因组图谱，筛选其matK基因并对其密码子偏好性进行分析。结果表明：(1)GC1、GC2、GC3的平均值分别为39.09、31.75、27.98,密码子第1位的GC含量最高，第3位的GC含量最低，具有显著差异性；有效密码子数与第3位密码子的GC含量显著相关；(2)GC3与GC12的相关性不显著，且密码子的偏好性受自然选择的影响；(3)matK基因的有效密码子数低于预期值，位于标准曲线的下方，说明matK基因密码子的偏好性受到了选择的影响；(4)共计29个密码子的同义密码子相对使用度(RSCU)大于1,其中，有27个密码子均以A/U结尾，仅有2个密码子以G结尾，说明matK基因的密码子偏好以A或者U结尾。RSCU较高的3个密码子为UGA(3.00)、UCU(2.08)、ACU(1.98)。
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| 关 键 词： | matK基因 叶绿体基因组 密码子偏好性 选择与突变 |
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