| 一株石油降解菌Aquabacterium olei NBRC 110486的基因组完成图及分析 |
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| 引用本文： | 唐标,常江,肖兴宁,吴静,钱鸣蓉,杨华.一株石油降解菌Aquabacterium olei NBRC 110486的基因组完成图及分析[J].浙江农业科学,2021,62(6):1213-1217. |
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| 作者姓名： | 唐标 常江 肖兴宁 吴静 钱鸣蓉 杨华 |
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| 作者单位： | 1.浙江省农业科学院a 农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室,b 农产品质量安全与营养研究所,浙江 杭州 3100212.上海交通大学 农业与生物学院,上海 200240 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目(31700007);浙江省重点研发计划(2020C02031);省部共建农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室项目(2010DS700124-ZZ2008) |
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| 摘 要： | Aquabacterium olei RBRC 110486是一种新发现的具有降解石油能力的革兰氏阴性菌。为进一步探究该菌株降解石油的分子机制,挖掘菌株可能存在的生物功能,本研究使用PacBio高通量测序技术对其进行全基因组测序,基于完成图进行基因预测、功能注释以及次级代谢产物合成基因簇预测。该菌株基因组大小为3 890 087 bp,GC含量为67.33%,共3 402个蛋白;另外发现大小为366 221 bp的环形质粒pTB101,GC含量为66.91%,325个蛋白。共预测到2个可能的次级代谢产物合成基因簇。定位了该菌株的石油降解关键酶链烷1-单加氧酶AlkB,与假单胞菌属聚类在同一个分支。该基因组是Aquabacterium属的首个报道的序列完成图,已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库,登录号分别为CP029210和CP029211。以上研究将为菌株NBRC 110486的功能基因组学及石油降解特性研究提供基础数据。
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| 关 键 词： | Aquabacterium oleiNBRC 110486 全基因组完成图 石油降解 |
| 收稿时间： | 2021-04-17 |
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