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景宁木兰PIF转录因子的生物信息学分析及极端遮阴条件下的表达模式

引用本文：	陆丹迎,程少禹,章颖佳,刘志高,金梦婷,董彬,张寿洲,彭豪,戴梦怡,王卓为,赵宏波,申亚梅.景宁木兰PIF转录因子的生物信息学分析及极端遮阴条件下的表达模式[J].浙江农林大学学报,2021,38(3):445-454.

作者姓名：	陆丹迎程少禹章颖佳刘志高金梦婷董彬张寿洲彭豪戴梦怡王卓为赵宏波申亚梅

作者单位：	1.浙江农林大学风景园林与建筑学院，浙江杭州 3113002.深圳市/中国科学院仙湖植物园，广东深圳 518004

基金项目：	“十三五”浙江省林木新品种选育专项(2016C02056-1)；浙江省重点研发项目(2019C02023)

摘要：	目的群落所造成的遮阴是导致景宁木兰Magnolia sinostellata濒危的重要因素之一。PIF家族转录因子在光信号传导和植物生长发育中起到重要作用。对PIF家族转录因子进行系统分析和研究，为探究其在景宁木兰光信号转导机制中的作用奠定基础。方法从景宁木兰转录组数据中鉴定获得PIF家族转录因子并进行生物信息学分析，利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术对其在极端遮阴条件下的表达模式进行分析。结果从景宁木兰转录组中共筛选出9个MsPIFs转录因子基因，其编码的蛋白质长度为188~735 个氨基酸，蛋白质大小为20 314.56~78 957.02 Da，理论等电点范围为5.18~8.22。MsPIFs基因编码的蛋白质均为不稳定蛋白质，所有蛋白质均为亲水性蛋白质。亚细胞定位预测结果显示所有蛋白质均定位于细胞核。9个蛋白质均具有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Try)磷酸化位点。qRT-PCR结果表明:极端遮阴条件下，9个MsPIFs家族基因表达均发生不同程度的变化。其中，MsbHLH23的表达变化较其他基因更为明显，遮阴处理5和10 d时的表达量分别上调为对照的52.77与20.03倍。结论景宁木兰PIF转录因子家族均能响应遮阴，为后续对MsPIFs进行生物学功能鉴定奠定了基础。图7表3参32
关键词：	景宁木兰极端遮阴 PIF转录因子家族生物信息学分析表达模式
收稿时间：	2020-07-28
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