| 玉米大斑病菌StPEX11基因家族的鉴定及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 马兰,薛韶娜,冯胜泽,赵洁,巩校东,谷守芹,韩建民,董金皋.玉米大斑病菌StPEX11基因家族的鉴定及生物信息学分析[J].玉米科学,2016,24(6):36-40. |
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| 作者姓名： | 马兰 薛韶娜 冯胜泽 赵洁 巩校东 谷守芹 韩建民 董金皋 |
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| 作者单位： | 河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000,河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000,河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000,河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000,河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000,河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000,河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000,河北农业大学生命科学学院/植物分子病理学实验室, 河北 保定 071000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31171805，31271997，31371897）、河北省自然科学基金项目（C2012204033，C2013204061） |
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| 摘 要： | PEX11基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子。在玉米大斑病菌基因组中鉴定出2个PEX11基因,根据其相对分子质量分别命名为StPEX11-1和StPEX11-2。利用生物信息学方法,对基因结构、蛋白质的保守结构域及理化性质进行分析,预测其二级结构域。系统发育树分析发现,玉米大斑病菌的2个StPEX11基因分别属于I型和III型的PEX11亚家族。
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| 关 键 词： | 玉米 玉米大斑病菌 StPEX11基因家族 过氧化物酶体 |
| 收稿时间： | 2016/3/21 0:00:00 |
Identification and Bioinformatics Analysis of Setosphaeriaturcica StPEX11 Gene Family |
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| MA Lan,XUE Shao-n,FENG Sheng-ze,ZHAO Jie,GONG Xiao-dong,GU Shou-qin,HAN Jian-min and DONG Jin-gao.Identification and Bioinformatics Analysis of Setosphaeriaturcica StPEX11 Gene Family[J].Journal of Maize Sciences,2016,24(6):36-40. |
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| Authors: | MA Lan XUE Shao-n FENG Sheng-ze ZHAO Jie GONG Xiao-dong GU Shou-qin HAN Jian-min and DONG Jin-gao |
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| Institution: | Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China,Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China,Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China,Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China,Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China,Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China,Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China and Agricultural University of Hebei, Mycotoxin and Molecular Plant Pathology Laboratory, Baoding 071000, China |
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| Abstract: | PEX11 gene family members are key factors which are involved in the regulation of peroxisome proliferation. Two PEX11 genes that named StPEX11-1 and StPEX11-2 were identified in this study. Based on their molecular weight in Setosphaeriaturcica genome and bioinformatics methods was used to analyze the gene structure, conserved domains, physical and chemical properties and predictthe secondary structure. Furthermore, phylogenetictree analysis revealed that the two genes belong to the type I and type III of PEX11 in fungi, respectively. |
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| Keywords: | Maize Setosphaeriaturcica StPEX11 gene family Peroxisome |
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