| 3个不同品种百香果转录组分析 |
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| 引用本文： | 王宇,陈楠,袁启凤,王红林,韩秀梅,周俊良.3个不同品种百香果转录组分析[J].种子,2019(5):1-7. |
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| 作者姓名： | 王宇 陈楠 袁启凤 王红林 韩秀梅 周俊良 |
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| 作者单位： | 贵州省农业科学院果树科学研究所 |
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| 基金项目： | 贵州省农业科学院2017年度学术新苗培养及创新探索专项——西番莲糖含量差异及糖代谢相关基因表达分析(黔农科院青年基金[2018]89号);西番莲果实营养成分及主要成分分析与研究(黔农科院青年基金[2018]09号);贵州北盘江流域西番莲区域试验及配套栽培模式研究(黔科合支撑[2016]2527号);贵州省科技厅项目“台湾等地区优新果树品种引进试种及示范”(黔科合NZ[2015]3001);贵州省科技厅项目“贵州省果树科学研究所扶贫能力建设”(黔科合平台人才[2017]5795-3);科技部项目“贵州山地特色果树资源评价与应用创新平台”(黔科中引地[2018]4002) |
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| 摘 要： | 以黄果、满天星和紫果3个不同品种百香果果皮和果肉为材料,采用2代Illumina高通量测序技术进行转录组测序,获得黄果果皮47 875 830条、果肉44 325 678条,满天星果皮47 019 772条、果肉45 472 434条,紫果果皮48 789 846条、果肉49 372 968条Clean reads片段,包含黄果果皮7 181 374 500 nt、果肉6 648 851 700 nt,满天星果皮7 052 965 800 nt、果肉6 820 865 100 nt,紫果果皮7 318 476 900 nt、果肉7 405 945 200 nt核苷酸序列信息;经拼接组装,分别获得平均长度为1 487 nt的黄果34 968条Unigene片段,平均长度1 361 nt的满天星41 896条Unigene片段和平均长度1 329 nt的紫果41 701条Unigene片段。GO富集分析表明,在生物过程、细胞组分和分子功能3大类别上,黄果、满天星和紫果间均分布有差异基因。KEGG富集分析表明,黄果与满天星在细胞胞吞作用过程中存在较大差异,黄果与紫果在玉米素生物合成和糖酵解途径中差异基因富集显著,满天星与紫果在缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成中存在较大差异。
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| 关 键 词： | 百香果 转录组 基因差异表达 |
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