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珍珠贝基于16S rRNA基因序列的亲缘关系研究
引用本文:黄桂菊,喻达辉,郭奕惠,曲妮妮.珍珠贝基于16S rRNA基因序列的亲缘关系研究[J].南方水产,2009,5(6):47-53.
作者姓名:黄桂菊  喻达辉  郭奕惠  曲妮妮
作者单位:农业部海水养殖生态与质量控制重点开放实验室,中国水产科学院南海水产研究所,广东,广州,510300
基金项目:国家科技支撑计划项目,国家高技术研究发展计划(863计划)项目,广东省科技计划项目 
摘    要:利用PCR技术分别扩增合浦珠母贝(Pinctada fucata)、长耳珠母贝(P.chemnitzi)和企鹅珍珠贝(Pteria penguin)的16S rRNA基因片段,PCR产物直接测序,删去引物及部分端部序列后,得到439bp可供分析的核苷酸片段,用MEGA3.1软件分析了核苷酸差异。结果表明,合浦珠母贝种内个体间序列完全相同,长耳珠母贝种内个体间有2个颠换(Transversion)突变位点,而企鹅珍珠贝种内个体间有1个转换(Transision)突变位点,5个颠换(Transversion)突变位点。与GenBank数据库中其他9种珍珠贝的序列进行比较,得到464个同源比对位点,包括51个插入/缺失位点和231个变异位点(173个简约信息位点和53个单突变子)。合浦珠母贝与长耳珠母贝的同源性为83.2%,合浦珠母贝、长耳珠母贝与企鹅珍珠贝的同源性分别为55.4%和59%。NJ系统进化树表明合浦珠母贝和长耳珠母贝与珠母贝属的种类聚在一起,而企鹅珍珠贝与珍珠贝属的种类聚在一起,与形态学分类一致。

关 键 词:珍珠贝  16S  rRNA基因  序列分析

Phylogenetic relationship of pearl oysters in genus Pinctada based on partial mitochondrial 16S rRNA sequence
HUANG Guiju,YU Dahui,GUO Yihui,QU Nini.Phylogenetic relationship of pearl oysters in genus Pinctada based on partial mitochondrial 16S rRNA sequence[J].South China Fisheries Science,2009,5(6):47-53.
Authors:HUANG Guiju  YU Dahui  GUO Yihui  QU Nini
Abstract:
Keywords:16S
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