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基于线粒体 DNA D-loop 全序列的麒麟鸡遗传多样性研究
引用本文:李威娜,郭美慧,温锦添,翁茁先,陈洁波,杜炳旺,黄勋和.基于线粒体 DNA D-loop 全序列的麒麟鸡遗传多样性研究[J].广东农业科学,2023,50(4):100-107.
作者姓名:李威娜  郭美慧  温锦添  翁茁先  陈洁波  杜炳旺  黄勋和
作者单位:1. 嘉应学院生命科学学院,广东 梅州 514015;2. 广东省山区特色农业资源保护与精准利用重点实验室,广东 梅州 514015;3. 广东省五华三黄鸡科技创新中心,广东 梅州 514015
基金项目:嘉应学院大学生创新创业训练项目(嘉院校办〔2021〕20 号);广东省驻镇帮镇扶村农村科技特派员项目(KTP20210218);广东省重点建设学科科研能力提升项目(2022ZDJS088);湛江市科技计划项目(2020A04008)
摘    要:【目的】从线粒体DNA(mtDNA) D-loop全序列角度评估麒麟鸡的遗传多样性水平,以期阐明麒麟鸡的品种形成。【方法】通过PCR产物直接测序法对麒麟鸡保种群的黄羽、白羽和黑羽3个资源群及8个地方鸡品种进行mtDNA D-loop全序列测定,分析遗传变异,并进行中性检测,构建单倍型中介网络图,探究麒麟鸡的群体历史。【结果】麒麟鸡mtDNA D-loop全序列为1 231~1 232 bp,C+G含量(39.8%)低于T+A含量(60.2%),总体核苷酸多样性为0.00630±0.00054,明显高于其他8个地方鸡品种。3个资源群黄羽、白羽和黑羽麒麟鸡的单倍型多样性分别为0.777±0.076、0.816±0.060、0.710±0.057,核苷酸多样性分别为0.00699±0.00115、0.00662±0.00090、0.00546±0.00062,遗传多样性水平基本上与群体规模呈正相关。麒麟鸡与8个地方鸡的双参数遗传距离为0.008~0.009,净遗传距离为0.003~0.005,均大于其他地方鸡之间的遗传距离。90份麒麟鸡样本共检测到45个突变位点,定义了17个单倍型,其中独享...

关 键 词:麒麟鸡  线粒体DNA(mtDNA)  D-loop全序列  遗传多样性  系统进化

Study on Genetic Diversity of Qilin Chicken Based on Complete Mitochondrial DNA D-loop Sequences
LI Wein,GUO Meihui,WEN Jintian,WENG Zhuoxian,CHEN Jiebo,DU Bingwang,HUANG Xunhe.Study on Genetic Diversity of Qilin Chicken Based on Complete Mitochondrial DNA D-loop Sequences[J].Guangdong Agricultural Sciences,2023,50(4):100-107.
Authors:LI Wein  GUO Meihui  WEN Jintian  WENG Zhuoxian  CHEN Jiebo  DU Bingwang  HUANG Xunhe
Abstract:
Keywords:Qilin chicken  mitochondrial DNA (mtDNA)  D-loop complete sequence  genetic diversity  phylogeny
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