| 利用PyBSASeq算法挖掘大豆百粒重相关位点与候选基因 |
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| 引用本文： | 王娟,张彦威,焦铸锦,刘盼盼,常玮.利用PyBSASeq算法挖掘大豆百粒重相关位点与候选基因[J].作物学报,2022(3):635-643. |
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| 作者姓名： | 王娟 张彦威 焦铸锦 刘盼盼 常玮 |
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| 作者单位： | 南阳师范学院生命科学与农业工程学院;山东省农业科学院作物研究所 |
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| 基金项目： | 河南省科技攻关项目(192102110125);南阳师范学院青年基金项目(QN2016003)资助。 |
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| 摘 要： | 基于量化染色体区间上与目标性状相关多态性位点的富集程度这一原理开发的PyBSASeq算法,被证实更适合进行基于BSA-seq技术的复杂数量性状遗传解析。本研究采用该算法,以‘滑皮豆’和‘齐黄26’为亲本杂交所衍生的包含149个RILs为材料,挖掘与大豆百粒重相关位点,共获得11个与目标性状紧密关联的候选区域,分别位于1号、2号、4号、7号、9号、14号和16号染色体,其中qSW4-1、qSW9-1、qSW9-2和qSW7-1与已报道大豆百粒重QTL位置一致。候选区域共包含218个编码基因,根据基因表达特性和单倍型分析结果,最终获得2个与目标性状相关的候选基因Glyma.02G075000和Glyma.04G082500,分别参与蔗糖的运输和维生素E的生物合成。研究结果将有助于大豆百粒重遗传机制的阐释,并为基于BSA-Seq技术的数量性状研究提供参考。
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| 关 键 词： | 大豆 百粒重 PyBSASeq SLAF-Seq |
Identification of QTLs and candidate genes for 100-seed weight trait using PyBSASeq algorithm in soybean |
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| WANG Juan,ZHANG Yan-Wei,JIAO Zhu-Jin,LIU Pan-Pan,CHANG Wei.Identification of QTLs and candidate genes for 100-seed weight trait using PyBSASeq algorithm in soybean[J].Acta Agronomica Sinica,2022(3):635-643. |
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| Authors: | WANG Juan ZHANG Yan-Wei JIAO Zhu-Jin LIU Pan-Pan CHANG Wei |
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| Institution: | (School of Life Science and Agricultural Engineering,Nanyang Normal University,Nanyang 473061,Henan,China;Crop Research Institute,Shandong Academy of Agricultural Sciences,Jinan 250100,Shandong,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | soybean 100-seed weight PyBSASeq SLAF-Seq |
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