| 持续感染口蹄疫病毒VP1蛋白对细胞转录组的影响 |
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| 引用本文： | 杨黎,刘萍,韦美华,柯雄锋,刘丽清,宋静静,方莹,唐欢,孔令保,辛秀.持续感染口蹄疫病毒VP1蛋白对细胞转录组的影响[J].江西农业大学学报,2022,44(2):411-421. |
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| 作者姓名： | 杨黎 刘萍 韦美华 柯雄锋 刘丽清 宋静静 方莹 唐欢 孔令保 辛秀 |
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| 作者单位： | 江西农业大学 病原微生物研究所,江西 南昌 330045;江西农业大学 生物科学与工程学院,江西 南昌330045;南昌市动物病毒与基因工程重点实验室,江西 南昌 330045 |
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| 基金项目： | 江西省自然科学基金青年项目（20192BAB214001）~~； |
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| 摘 要： | 【目的】通过转录组测序（RNA-Seq）方法分析持续感染口蹄疫病毒结构蛋白VP1诱导的PK-15细胞基因表达谱的变化，探索VP1蛋白对宿主细胞信号通路的影响。为后续开展VP1影响FMDV持续感染相关机制研究提供基础数据和理论支持。【方法】PK-15细胞分别转染pCAGGS-HA（对照载体）、pCAGGS-HA-Pi-VP1质粒，转染36 h后，Western blot检测VP1蛋白表达，同时提取两组细胞总RNA进行转录组测序（每组3个重复，2组6个样本）。将测序所得的序列进行过滤比对，获得差异表达基因后，对差异表达基因进行了生物信息学分析。采用qRT-PCR验证关键差异表达基因的表达。【结果】RNA-Seq共鉴定出3 376个差异表达基因（DEGs）|log2(Fold Change)|>0和padj<0.05，其中上调基因1 744个，下调基因1 632个。许多参与免疫反应和炎症的效应基因差异表达。GO和KEGG富集分析显示，差异基因GO条目绝大部分与核糖体有关，而KEGG富集中涉及了与天然免疫相关的信号通路，如TNF信号通路、Toll受体信号通路。【结论】pCAGGS-...
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| 关 键 词： | 转录组 基因表达谱 FMDV 持续感染 VP1 差异表达基因 |
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