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核桃 JrCOR413 基因家族鉴定与表达分析
引用本文:刘凯,李瑶玲,李洋,王红霞,赵书岗,安秀红,张志华.核桃 JrCOR413 基因家族鉴定与表达分析[J].河北农业大学学报,2022,45(2):14-20.
作者姓名:刘凯  李瑶玲  李洋  王红霞  赵书岗  安秀红  张志华
作者单位:河北农业大学 园艺学院,河北 保定 071001;河北农业大学 山区研究所/河北省农业工程中心/国家北方山区工程中心,河北 保定 071001,河北农业大学 生命科学学院,河北 保定 071001,河北省农林科学院 植物保护研究所,河北 保定 071001,河北农业大学 山区研究所/河北省农业工程中心/国家北方山区工程中心,河北 保定 071001
基金项目:国家重点研发计划项目(2019YFD1001603);;河北省自然科学基金资助项目(C2019204270);
摘    要:为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。

关 键 词:核桃  冷胁迫  COR413基因家族  表达分析

Identification and expression analysis of JrCOR413 gene family in walnut
LIU Kai,LI Yaoling,LI Yang,WANG Hongxia,ZHAO Shugang,AN Xiuhong,ZHANG Zhihua.Identification and expression analysis of JrCOR413 gene family in walnut[J].Journal of Agricultural University of Hebei,2022,45(2):14-20.
Authors:LIU Kai  LI Yaoling  LI Yang  WANG Hongxia  ZHAO Shugang  AN Xiuhong  ZHANG Zhihua
Abstract:
Keywords:
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