| 青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达 |
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| 引用本文： | 姚晓华,王越,姚有华,安立昆,王燕,吴昆仑.青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达[J].作物学报,2022(5):1181-1190. |
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| 作者姓名： | 姚晓华 王越 姚有华 安立昆 王燕 吴昆仑 |
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| 作者单位： | 青海大学;青海省农林科学院/青海省青稞遗传育种重点实验室/国家麦类改良中心青海青稞分中心 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31960427,31660388);青海省科技厅应用基础研究项目(2019-ZJ-7075);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-05);国家重点研发计划项目(2020YFD1001403)资助。 |
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| 摘 要： | 为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO。HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋白质编码区(CDS, coding domain sequence)在昆仑14号和1141品种中的一致性为100%,无内含子,全长3161 bp,包含一个3129 bp开放阅读框,编码1043个氨基酸,理论等电点为9.33,预测蛋白分子量为115,865.58Da。蛋白质序列分析表明,HvMEL1AGO为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域,属于AGO基因家族成员。进化树分析表明,HvMEL1AGO与大麦AGO家族中HvAGO12、HvAGO18、HvAGO1D、HvAGO1B在拟南芥AGO家族系统发育树上属于AGO1一类;与HvAGO12的亲缘关系最近。蛋白质互作预测结果表明,在水稻中与MEL1作用密切的已知蛋白为DCL类,分别为DCL1、DCL2A、DCL3A、DCL3B和DCL4。半定量...
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| 关 键 词： | 青稞 条纹病 HvMEL1 AGO基因 基因表达 |
Isolation and expression of a new gene HvMEL1 AGO in Tibetan hulless barley under leaf stripe stress |
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| YAO Xiao-Hua,WANG Yue,YAO You-Hua,AN Li-Kun,WANG Yan,WU Kun-Lun.Isolation and expression of a new gene HvMEL1 AGO in Tibetan hulless barley under leaf stripe stress[J].Acta Agronomica Sinica,2022(5):1181-1190. |
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| Authors: | YAO Xiao-Hua WANG Yue YAO You-Hua AN Li-Kun WANG Yan WU Kun-Lun |
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| Institution: | (Qinghai University,Xining 810016,Qinghai,China;Qinghai Academy of Agriculture and Forestry Academy/Qinghai Key Laboratory of Hulless Barley Genetics and Breeding/Qinghai Subcenter of National Hulless Barley Improvement,Xining 810016,Qinghai,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | hulless barley leaf stripe HvMEL1 AGO gene relative expression level |
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