| 猪流行性腹泻病毒变异株（CH/YNKM 8/2013）的分离鉴定和全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 吴美洲,陈芳洲,李中华,万胜锋,叶十一,何启盖.猪流行性腹泻病毒变异株（CH/YNKM 8/2013）的分离鉴定和全基因组序列分析[J].华中农业大学学报,2016,35(4):93-99. |
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| 作者姓名： | 吴美洲 陈芳洲 李中华 万胜锋 叶十一 何启盖 |
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| 作者单位： | 农业微生物学国家重点实验室/华中农业大学动物医学院,武汉,430070 |
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| 基金项目： | 国家现代产业(生猪)技术体系项目（CARS 36）；国家自然科学基金项目（31272572） |
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| 摘 要： | 为研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)变异株特性,通过细胞培养、细胞病变(CPE)观察、RT-PCR、间接免疫荧光实验和透射电镜观察分离鉴定1株PEDV变异株(CH/YNKM-8/2013株)并分析了全基因组序列。运用基因组分段扩增方法,测得该毒株的全基因组序列(GenBank登录号为KF761675.1)。该毒株S基因N端比CV777毒株S基因的N端长9bp,包括15bp的插入和6bp的缺失,表明CH/YNKM-8/2013为变异毒株。同源性分析显示,该毒株的基因组序列与我国广东2011年分离毒株LC的同源关系最近,相似性为99.6%,与韩国毒株KNU-1305和美国毒株USA/Minnesota84/2013的序列相似性均为99.0%,而与CV777疫苗毒株的相似性较低,为96.7%。序列进化树分析表明该毒株和我国新近毒株、韩国及美国的变异毒株进化关系较近,而与我国之前流行的PEDV毒株以及疫苗毒株CV777处于不同分支。
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 变异毒株 分离 鉴定 全基因组序列分析 |
| 收稿时间： | 2015/11/30 0:00:00 |
Isolation,identification and full length genome sequence analysis of a variant porcine epidemic diarrhea virusCH/YNKM8/2013 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine epidemic diarrhea virus variant strain isolation identification full genome sequence analysis |
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