| 裂腹鱼亚科系统发育与适应性进化及祁连山裸鲤的分类地位 |
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| 引用本文： | 宋丹,彭頔,程起群.裂腹鱼亚科系统发育与适应性进化及祁连山裸鲤的分类地位[J].中国水产科学,2023,30(6):685-698. |
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| 作者姓名： | 宋丹 彭頔 程起群 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院东海水产研究所, 上海 200090 ；上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306 6 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32273140). |
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| 摘 要： | 裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)系统发育和适应性进化机制尚不明确,且祁连山裸鲤(Gymnocyprischilianensis)的分类地位尚存争议。本研究基于所有已公开的裂腹鱼亚科11属65种鱼类的线粒体全基因组序列进行分析,试图为阐明上述问题提供基因组学依据。结果如下:(1)系统发育。研究表明裂腹鱼亚科鱼类不是单系群,其分属于两个不同的支系,每个支系包含若干属种,其中原始类群的裂腹鱼聚为一支,特化类群和高度特化类群的裂腹鱼聚为另一支。(2)适应性进化。以裂腹鱼的分布海拔高度区间为划分标准,分为低、中、高3组,基于分支模型和位点模型的检测结果显示, 13个蛋白编码基因的ω比值都<1,均未检测到正选择位点。但是在氨基酸水平上, Atp6、ND2、ND3、ND4、ND5中均检测出正选择位点,正选择作用主要发生在呼吸链复合物I (NADH-泛醌氧化还原酶)中,线粒体呼吸链又是生物活性氧(ROS)最主要的来源,这可能解释了裂腹鱼亚科对高海拔缺氧环境的适应性进化机制。同时,分歧时间估算结果显示,原始类群裂腹鱼分化于3.200Ma前,特化类群裂腹鱼与高度特化类群裂腹鱼在5.97...
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| 关 键 词： | 裂腹鱼亚科 祁连山裸鲤 系统发育 适应性进化 线粒体基因组 |
| 收稿时间： | 2023/4/13 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/4/30 0:00:00 |
Phylogenetic and adaptive evolution analysis of Schizothoracinae fish and the taxonomic status of Gymnocypris chilianensis |
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| SONG Dan,PENG Di,CHENG Qiqun.Phylogenetic and adaptive evolution analysis of Schizothoracinae fish and the taxonomic status of Gymnocypris chilianensis[J].Journal of Fishery Sciences of China,2023,30(6):685-698. |
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| Authors: | SONG Dan PENG Di CHENG Qiqun |
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