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半番鸭羽色相关基因均一化差减文库的构建和鉴定
引用本文:郑嫩珠,陈晓燕,卢立志,朱志明,缪中纬,辛清武,陈晖,肖天放.半番鸭羽色相关基因均一化差减文库的构建和鉴定[J].中国农业科学,2012,45(22):4688-4696.
作者姓名:郑嫩珠  陈晓燕  卢立志  朱志明  缪中纬  辛清武  陈晖  肖天放
作者单位:1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所, 福州 350013 2.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,杭州 310021 3.福建农林大学动物科学学院,福州 350002
基金项目:福建省自然基金项目(2010J01107)、福建省种业创新与产业化工程项目(2011FJZY-9-02)、现代农业产业技术体系建设专项(nycytx- 45-06)
摘    要:【目的】分离半番鸭羽色相关基因,探索半番鸭羽色基因表达调控的分子机制。【方法】以半番鸭白羽皮肤和黑羽皮肤分别作为试验组(tester)和驱动组(driver),利用双链特异性核酸酶(duplexspecific nuclease,DSN)介导的均一化消减杂交方法,构建半番鸭羽色相关基因消减cDNA文库,同时采用实时荧光定量PCR方法对文库质量进行验证。【结果】①从文库中随机选取144个阳性克隆进行测序分析,最终共获得64条有效序列,平均长度为1 031 bp;经BLAST比对发现,21条具有同源序列,且同源性平均为92.8%;43条未找到匹配序列,推测可能为羽色相关新基因;②Geneontology功能分析表明,已知基因参与信号转导、细胞结构、物质转运、细胞凋亡、细胞与机体防御、转录与表达调控等诸多生物学过程,并且与色素形成和转运存在不同程度的相关性。【结论】经实时荧光定量PCR鉴定后,所建文库质量良好,能够有效地富集白羽皮肤特异表达基因。

关 键 词:半番鸭  羽色基因  双链特异性核酸酶(DSN)  消减杂交  荧光定量PCR  
收稿时间:2012-04-19

Construction and Identification of Normalized Subtractive cDNA Library of Plumage Color-Related Genes in Mule Duck
ZHENG Nen-Zhu,CHEN Xiao-Yan,LU Li-Zhi,ZHU Zhi-Ming,MIAO Zhong-Wei,XIN Qing-Wu,CHEN Hui,XIAO Tian-Fang.Construction and Identification of Normalized Subtractive cDNA Library of Plumage Color-Related Genes in Mule Duck[J].Scientia Agricultura Sinica,2012,45(22):4688-4696.
Authors:ZHENG Nen-Zhu  CHEN Xiao-Yan  LU Li-Zhi  ZHU Zhi-Ming  MIAO Zhong-Wei  XIN Qing-Wu  CHEN Hui  XIAO Tian-Fang
Institution:1.Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013 2.Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021 3.Institute of Animal Science, Fujian Agricultural and Forestry University, Fuzhou 350002
Abstract:
Keywords:mule duck  plumage color gene  duplex-specific nuclease (DSN  subtractive hybridization  real-time PCR
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