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广西仔猪腹泻病毒病原流行病学调查
引用本文:郭,旋,陈,静,刘,欢,侯韶毅,龙,凤,李莹莹,曾,娟,兰家暖,刘,芳,黄伟坚.广西仔猪腹泻病毒病原流行病学调查[J].南方农业学报,2012,44(1):155-160.
作者姓名:            侯韶毅      李莹莹      兰家暖      黄伟坚
作者单位:(1 广西大学动物科学技术学院 南宁 530005 2 玉林市动物疫病预防控制中心 广西 玉林 537000 3 广西柯新源(集团)原种猪有限责任公司 南宁 530001)
基金项目:广西科学研究与技术开发计划项目(桂科攻1123007-3)
摘    要:【目的】了解引起广西仔猪腹泻的主要病毒病原及其分子流行病学特点,为其防控提供理论依据。【方法】采用RT-PCR对2011年至2012年7月从广西11个城市的养猪场采集的232份病料进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(PoRV)检测和流行病学调查;对部分PEDV阳性病料的M基因进行克隆,并与国内部分省(市)及国外的一些M基因序列进行比对和遗传进化分析。【结果】广西11个城市采集的232份病料中PEDV、PoRV的阳性率分别为37.50%和0.03%,而TGEV均为阴性。对部分PEDV阳性病料进行M基因扩增,获得14条M基因,其核苷酸同源性及推导氨基酸序列同源性分别为97.4%~100.0%和96.0%~100.0%。将扩增获得的14条PEDV M基因与GenBank上发表的40条国内外PEDV M基因进行比对分析,发现有13条同位于一大支上(G1),其中9条与我国2011年分离获得的广东、四川、江苏参考株及泰国2008年分离获得的5条参考株、韩国2007年分离获得的两条参考株同位于G1-1上,4条与我国2011年分离获得的江西、江苏、广东、福建毒株及江苏2004年分离株JS-2004-2 同位于G1-2上。另外一条PEDV M基因(NNA-11)却与其余13条相距较远,位于G2上。【结论】从2011年至今致使广西仔猪腹泻的病毒主要是PEDV,各市均有不同程度感染,且感染全年存在;大部分广西流行毒株与2011年以来我国广东、福建、江苏、江西四省流行毒株的亲缘性较高,与2007年以来泰国、韩国的流行毒株亲缘关系也非常密切,但与我国2006年前分离获得的北方毒株、经典疫苗株、韩国疫苗株相距较远。

关 键 词:仔猪腹泻病  猪流行性腹泻病毒  猪传染性胃肠炎病毒  猪轮状病毒  流行病学  M基因  广西
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