| 大白菜硫代葡萄糖甙合成基因SSR标记的开发 |
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| 引用本文： | 巩红影,罗双霞,顾爱侠,王彦华,赵建军,申书兴.大白菜硫代葡萄糖甙合成基因SSR标记的开发[J].农业生物技术学报,2014,22(10). |
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| 作者姓名： | 巩红影 罗双霞 顾爱侠 王彦华 赵建军 申书兴 |
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| 作者单位： | 河北农业大学园艺学院/河北省蔬菜种质创新与利用重点实验室,保定,071001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，高等学校博士学科点专项基金，河北省杰出青年科学基金，河北省高等学校科学技术研究项目，河北省自然科学基金项目 |
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| 摘 要： | 硫代葡萄糖甙(glucosinolates,GS)是一种含氮、硫的重要植物次生代谢产物,是十字花科蔬菜风味的主要来源。本研究根据拟南芥(Arabidopsis thaliana)和大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)基因组序列信息,比对GS生物合成相关基因的序列信息,发现大白菜中与GS含量相关的候选基因102个,分布于10条染色体上。拟南芥GS合成基因在大白菜中的同源基因个数分别为:零拷贝基因8个、单拷贝基因13个、2拷贝基因17个、2个以上多拷贝基因14个。通过FASTPCR6.0软件分析目标基因上下游序列各5kb,共开发出237个简单重复序列(SSR)位点,16个基因没有发现SSR位点,72个基因存在1~4个SSR位点,5个基因存在5个SSR位点,4个基因存在6个SSR位点,4个基因存在7个SSR位点,1个基因存在8个SSR位点。所开发的SSR位点中,共发现4种重复类型:单核苷酸重复最多,共122个,占SSR总数的51.4%;其次是二核苷酸重复类型,共48个,占SSR总数的20.3%;三核苷酸重复类型最少,共7个,占SSR总数的3.0%,另外60个SSR无明显的重复类型。具有SSR位点的86个基因中,77个基因可以设计SSR特异引物,其中49对特异引物在供试的75份大白菜高代自交系中得到有效扩增。其中16对引物具有多态性,占全部引物的20.8%;18对引物无多态性,占全部引物的23.4%;15对引物杂带多,占全部引物的19.5%;另外28对引物无扩增产物,占全部引物的36.4%。最终11对获得了清晰多态性扩增产物,共检测出26个等位基因。本研究为分子标记辅助选择培育高有益GS成分的大白菜新品种提供了基础资料,进而加快大白菜营养品质育种的进程。
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| 关 键 词： | 大白菜 硫代葡萄糖甙(GS) 简单重复序列(SSR) 分子标记 |
Development of SSR Markers Linked to Glucosinolate Synthesis Genes in Chinese cabbage(Brassica rapa ssp.pekinensis) |
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| GONG Hong-Ying,LUO Shuang-Xia,GU Ai-Xia,WANG Yan-Hua,ZHAO Jian-Jun,SHEN Shu-Xing.Development of SSR Markers Linked to Glucosinolate Synthesis Genes in Chinese cabbage(Brassica rapa ssp.pekinensis)[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2014,22(10). |
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| Authors: | GONG Hong-Ying LUO Shuang-Xia GU Ai-Xia WANG Yan-Hua ZHAO Jian-Jun SHEN Shu-Xing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chinese cabbage Glucosinolates(GS) Simple sequence repeat(SSR) Molecular marker |
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