沙田柚RNase-like基因的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 刘玉洁,郭丹妮,张渝,覃信梅,李惠敏,秦新民.沙田柚RNase-like基因的克隆及序列分析[J].北方园艺,2015(24):70-74. |
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作者姓名: | 刘玉洁 郭丹妮 张渝 覃信梅 李惠敏 秦新民 |
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作者单位: | 广西师范大学生命科学学院,珍稀濒危动植物生态与环境保护省部共建教育部重点实验室,广西桂林541004 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目,广西教育厅资助项目 |
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摘 要: | 以沙田柚自交和异交花柱为试材,采用高通量测序技术对其进行转录组测序。通过差异分析得到RNase-like贮藏蛋白的基因序列,并研究了其理化性质。结果表明:该基因全长1 048bp(GenBank登录号为KR363153),开放阅读框(ORF)全长为693bp,共编码230个氨基酸,编码的蛋白质的分子量为25.82kDa,理论等电点为5.30,含有核苷酸结合的保守区域,属于RNase-T2超家族成员。该蛋白为疏水性蛋白,可能的磷酸化位点共有15个。氨基酸序列同源性分析表明,该基因编码的氨基酸与甜橙和克莱门柚的同源性均为99%。系统进化树显示沙田柚RNase-like贮藏蛋白基因与甜橙,克莱门柚的亲缘关系较近,属于同一进化分支。
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关 键 词: | 沙田柚 RNase-like基因 序列分析 |
Cloning and Sequence Analysis of RNase-like Gene From Citrus grandis var.Shatinyu Hort |
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Abstract: | |
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