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叶用莴苣LsARF1的生物信息学分析及其表达
引用本文:武扬,姜尚昆,韩春晖,王婷甄,范双喜,郝敬虹.叶用莴苣LsARF1的生物信息学分析及其表达[J].北京农学院学报,2021,36(2):36-41.
作者姓名:武扬  姜尚昆  韩春晖  王婷甄  范双喜  郝敬虹
作者单位:农业应用新技术北京市重点实验室/北京农学院植物科学技术学院,北京102206
基金项目:国家自然科学基金面上项目;2019年度北京高等学校高水平人才交叉培养“实培计划”大学生科研训练计划深化项目;2018年北京市自然科学基金-北京市教委联合重点项目;现代农业产业技术体系北京市叶类蔬菜创新团队;高精尖学科建设项目;北京农学院学位与研究生教育改革与发展项目
摘    要:目的]为了探究LsARF1基因在叶用莴苣抽薹中的作用机制.方法]采用ProtParam、SignalP4.0、SOPMA、NCBI CD-search、SWISS-MODEL、DNAMAN7.0、MEGA7等生物学软件对其进行生物信息学分析.实时荧光定量PCR分析该基因在不同温度下随时间变化的表达情况.结果]序列分析表明,该基因的开放阅读框为1968bp,编码656个氨基酸,并保留了ARF结构域.实时荧光定量PCR分析表明,在高温处理下,该基因在易抽薹品种GB-30中表达下调.结论]LsARF1基因可能在生菜抽薹过程中发挥重要作用.

关 键 词:叶用莴苣  LsARF1  生物信息学  表达  分析

Bioinformatics analysis of leaf lettuce LsARF1 and expression analysis in high-temperature bolting
WU Yang,JIANG Shangkun,HAN Chunhui,WANG Tingzhen,FAN Shuangxi,HAO Jinghong.Bioinformatics analysis of leaf lettuce LsARF1 and expression analysis in high-temperature bolting[J].Journal of Beijing Agricultural College,2021,36(2):36-41.
Authors:WU Yang  JIANG Shangkun  HAN Chunhui  WANG Tingzhen  FAN Shuangxi  HAO Jinghong
Abstract:
Keywords:
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