| ssc-miR-17-3p调控脂肪沉积的靶基因生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 赵志显,邢凯,常雪蕊,齐晓龙,盛熙晖,倪和民,王相国,肖龙菲,王楚端,郭勇.ssc-miR-17-3p调控脂肪沉积的靶基因生物信息学分析[J].北京农学院学报,2021,36(2):6-10. |
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| 作者姓名： | 赵志显 邢凯 常雪蕊 齐晓龙 盛熙晖 倪和民 王相国 肖龙菲 王楚端 郭勇 |
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| 作者单位： | 北京农学院动物科学技术学院,北京102206;中国农业大学动物科学技术学院,北京100193 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划资助;生猪产业技术体系北京市创新团队;北京市教委2019年度科技计划一般项目 |
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| 摘 要： | 目的]找到与猪脂肪沉积相关的候选靶基因,为ssc-miR-17-3p参与脂肪沉积调控机制研究提供相关理论依据. 方法]利用miRDB,miRWalk和TargetScan数据库获得了miRNA-17-3p候选靶基因;利用DAVID和KOBAS数据库对候选靶基因进行了KEGG/GO功能富集分析,并通过Cytoscape可视化工具构建了其可能参与的调控网络.结果]结果表明,ssc-miR-17-3p候选靶基因TSTD2、CSDE1、SCGB1 D1、TEAD1、GPD2、NFATC3、MBNL1、PPP1R12B、CAMK2D、HBEGF、LRRC28、UBE2D4、MAP4与脂肪沉积有关.GPD2、CAMK2D、HBEGF等可能在催产素信号通路、MAPK信号通路、GnRH信号通路,以及脂质代谢、甘油磷脂代谢、糖醇代谢、大分子代谢,细胞代谢等过程发挥了作用.结论]ssc-miR-17-3p可能通过调控多个靶基因,信号通路和生物过程影响脂肪的沉积与代谢,其功能有待进一步实验室试验验证.
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| 关 键 词： | ssc-miR-17-3p 脂肪沉积 靶基因预测 调控机制 |
Bioinformatics analysis of target genes regulated by ssc-miR-17-3p in fat deposition |
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| ZHAO Zhixian,XING Kai,CHANG Xuerui,QI Xiaolong,SHENG Xihui,Ni Hemin,WANG Xiangguo,XIAO Longfei,WANG Chuduan,GUO Yong.Bioinformatics analysis of target genes regulated by ssc-miR-17-3p in fat deposition[J].Journal of Beijing Agricultural College,2021,36(2):6-10. |
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| Authors: | ZHAO Zhixian XING Kai CHANG Xuerui QI Xiaolong SHENG Xihui Ni Hemin WANG Xiangguo XIAO Longfei WANG Chuduan GUO Yong |
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