1株新型鸭呼肠孤病毒(SL株)的全基因组测定分析及其致病性 |
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引用本文: | 杨晓伟,陆婧,王凯民,庄鸿琨,田宇森,李俊锋,朱盈名,刘霞,张立武,赵光伟.1株新型鸭呼肠孤病毒(SL株)的全基因组测定分析及其致病性[J].中国兽医学报,2022(11):2195-2201. |
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作者姓名: | 杨晓伟 陆婧 王凯民 庄鸿琨 田宇森 李俊锋 朱盈名 刘霞 张立武 赵光伟 |
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作者单位: | 1. 西南大学动物医学院;2. 南京海关动植物与食品检测中心;3. 贵州省动物疫病预防控制中心;4. 重庆三杰众鑫生物工程有限公司 |
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摘 要: | 为明确我国川渝地区鸭疑似呼肠孤病毒病的致病原,本试验对患病鸭进行病毒的分离、鉴定、全基因组测序分析及致病性试验。首先针对临床肝脾肿大、出血坏死为主要特征的病例,利用鸭胚传代法进行病毒的分离,结合RT-PCR方法鉴定分离毒株;其次利用二代测序技术对分离毒株进行全基因组测序,利用MEGA X软件对序列进行比对和分析;最后将分离毒接种7日龄健康雏鸭,观察其病死率及肝脏、脾脏组织的病理变化。结果发现F6代病毒能够稳定适应鸭胚,RT-PCR鉴定为呼肠孤病毒,对鸭胚的半数致死量(ELD50)为10-5.32/0.2 mL,分离毒命名为SL株。全基因测序显示该毒株全长23 580 bp, GC含量49.62%,共分10个节段,分别为L1~L3、M1~M3和S1~S4(GenBank登录号:MW196679~MW196688)。序列分析显示SL株与新型鸭呼肠孤病毒(novel duck reovirus, NDRV)具有较高的相似性,为87.02%~99.48%;与番鸭呼肠孤病毒(MDRV)的相似性次之,为80.09%~98.77%;而与鸡源呼肠孤病毒(AR...
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关 键 词: | 新型鸭呼肠孤病毒 分离鉴定 全基因组测序 系统进化树 |
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