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利用正交设计优化甘蔗SRAP-PCR反应体系
引用本文:昝逢刚,刘家勇,赵俊,赵培方,吴转娣,吴才文.利用正交设计优化甘蔗SRAP-PCR反应体系[J].中国甜菜,2011(3):6-8.
作者姓名:昝逢刚  刘家勇  赵俊  赵培方  吴转娣  吴才文
作者单位:云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室,开远616600
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金(nycytx-024-01-03); 云南省“十一五”科技攻关(2006NG11)
摘    要:利用正交设计L16(45)对甘蔗SRAP-PCR反应体系的五大因素(Mg2+、dNTPs、引物、模板DNA、Taq酶)在4个水平上进行优化,得到如下结论:各因素水平变化对PCR反应的影响从大到小依次是:Mg^2+、dNTPs、引物、Taq酶和模板DNA;通过对各因素进行筛选,建立甘蔗SRAP-PCR反应的最佳体系(20μL)为:dNTPs 0.25 mmol/L、引物0.1μmol/L、Mg^2+2.5 mmol/L、Taq酶0.25U和模板DNA 60 ng。

关 键 词:甘蔗  SRAP-PCR  正交设计  优化

Optimization for Sugarcane SRAP-PCR System by Orthogonal Design
Authors:ZAN Feng-gang  LIU Jia-yong  ZHAO Jun  ZHAO Pei-fang  WU Zhuan-di  WU Cai-wen
Institution:(Yunnan Province Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement /Sugarcane Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Kuaiyuan 616600,China)
Abstract:The orthogonal design was used to optimize SRAP-PCR amplification system on sugarcane in four levels of five factor(Mg2+,dNTPs,Taq DNA polymerase,primer and the DNA template),respectively.The result of PCR showed that the effect of each factor in different levels in the order from big to small was Mg2+,dNTPs,primer,Taq DNA polymerase and the DNA template.A most suitable SRAP-PCR system for sugarcane was established,the system of 20μl reaction contained 0.25 mmol/L dNTPs,0.1μmol/L primer,2.5 mmol/L Mg2+,0.25U Taq DNA polymerase and 60 ng DNA template.
Keywords:sugarcane  SRAP  orthogonal design  optimization
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