甜菜硝酸还原酶基因编码氨基酸偏好及功能预测分析 |
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引用本文: | 丁广洲,侯静,马凤鸣.甜菜硝酸还原酶基因编码氨基酸偏好及功能预测分析[J].中国甜菜,2011(4):3-6. |
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作者姓名: | 丁广洲 侯静 马凤鸣 |
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作者单位: | [1]中国农业科学院甜菜研究所,哈尔滨150080 [2]黑龙江大学农作物研究院,哈尔滨150080 [3]东北农业大学农学院,哈尔滨150030 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(30571096)项目 |
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摘 要: | 利用同源序列克隆方法从标准偏高糖型甜菜二倍体纯系Ty7中获得氮素诱导甜菜硝酸还原酶基因片段,通过RACE技术克隆基因全长序列;该基因ORF长度2718 bp,编码905个氨基酸,分子量大小为102kD(ExPaSy的分子量分析),等电点为6.12,含有147bp的5'UTR和382 bp的3'UTR,Genbank上的注册号为EU163265,甜菜硝酸还原酶基因编码多肽含有3个氧化还原功能区:钼辅因子功能区(eukary NR Moco;93-478),Fe-血红素结合区(Cyt-b5;535-608),FAD结合区(FAD binding 6;653-760)。利用网上的公共数据库和相关软件对该基因氨基酸偏好和编码蛋白的理化性质进行了分析,并对其功能进行了预测。上述研究结果为下一步基因的表达与调控研究奠定了基础。
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关 键 词: | 甜菜 硝酸还原酶基因 氨基酸偏好 功能预测 |
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