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广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区序列多态性及起源分析
引用本文:曹渊婷,黄英飞,王自豪,滕少花,黄光云,雷初朝,孙俊丽,廖玉英.广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区序列多态性及起源分析[J].中国牛业科学,2022,48(5):33-38.
作者姓名:曹渊婷  黄英飞  王自豪  滕少花  黄光云  雷初朝  孙俊丽  廖玉英
作者单位:西北农林科技大学,广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室,广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室,广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室,广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室,西北农林科技大学动物科技学院,广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室,广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室
基金项目:广西创新驱动发展专项(桂科AA17204024);国家现代农业产业技术体系项目(CARS-37)
摘    要:【目的】探究广西3个地方黄牛品种线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop区)序列的多态性及其母系起源,为广西地方黄牛品种的选育、系统分类和开发利用提供科学依据。【方法】利用PCR扩增、测序和生物信息学方法对广西3个地方黄牛品种(南丹黄牛、隆林黄牛和涠洲黄牛)mtDNA D-loop序列进行多态性分析与系统发育进化树构建。【结果】从广西3个地方黄牛品种127个个体mtDNA D-loop区序列中检测到27种单倍型,其核苷酸多态位点65个,多态位点占所测核苷酸总长(908~912 bp)的7.143%,其中有61个转换、3个颠换和1个转换/颠换共存。广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区单倍型多样度(H)为0.339~0.795,核苷酸多样度(π)为 0.31%~2.54%,表明广西3个地方黄牛品种mtDNA D-loop区的遗传多样性存在较大差异,其中,南丹黄牛具有更丰富的遗传多样性,隆林黄牛次之,涠洲黄牛的遗传多样性较贫乏。聚类分析结果表明,广西3个地方黄牛品种具有普通牛和瘤牛2大母系起源,受瘤牛起源影响更明显。【结论】广西3个地方黄牛品种具有瘤牛和普通牛两大母系起源,但受瘤牛影响更明显。隆林黄牛与南丹黄牛为瘤牛和普通牛的混合母系起源,而涠洲黄牛为纯正的瘤牛母系起源,因此,应加强对广西地方黄牛品种资源,尤其是对涠洲黄牛品种资源的保护力度。

关 键 词:广西黄牛  mtDNA  D-loop  遗传多样性  母系起源
收稿时间:2022/3/22 0:00:00
修稿时间:2022/4/12 0:00:00

Origin and Polymorphism of Mitochondrial DNA D-loop Sequences in Three Guangxi Cattle Breeds
caoyuanting,HUANG Ying-fei,WANG Zi-hao,TENG Shao-hu,HUANG Guang-yun,LEI Chu-zhao,SUN Jun-li and LIAO Yu-ying.Origin and Polymorphism of Mitochondrial DNA D-loop Sequences in Three Guangxi Cattle Breeds[J].China Cattle Science,2022,48(5):33-38.
Authors:caoyuanting  HUANG Ying-fei  WANG Zi-hao  TENG Shao-hu  HUANG Guang-yun  LEI Chu-zhao  SUN Jun-li and LIAO Yu-ying
Abstract:
Keywords:
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