| 锦鲤microRNA-137系统进化、靶基因验证及表达分析 |
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| 引用本文： | 李俊茹,马晓,吴利敏,刘慧芬,石西,宋红梅,田雪,李学军.锦鲤microRNA-137系统进化、靶基因验证及表达分析[J].水产学报,2021,45(6):831-845. |
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| 作者姓名： | 李俊茹 马晓 吴利敏 刘慧芬 石西 宋红梅 田雪 李学军 |
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| 作者单位： | 河南师范大学水产学院，河南省水产动物养殖工程技术研究中心，河南 新乡 453007;中国水产科学研究院珠江水产研究所，农业农村部休闲渔业重点实验室，广东 广州 510380 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31402294)；河南省科技攻关计划(农业领域)(192102110192) |
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| 摘 要： | 为了探究microRNA-137(miR-137)与锦鲤体色形成的关系,实验对已报道的14种鱼类miR-137前体序列(precursor miR-137, pre-miR-137)进行比对,利用最大似然估计法(Maximum Likelihood Estimate, MLE)构建系统进化树,同时荧光定量PCR (quantitative realtime PCR, qRT-PCR)分析其在体色发生阶段和不同组织中的相对表达水平,并预测其靶基因,随后对靶基因进行GO和KEGG分析,最后通过荧光素酶实验验证miR-137-3p与靶基因的靶向关系,并分析miR-137-3p与靶基因mRNA的表达变化。结果显示,锦鲤与鲤的pre-miR-137序列相似度最高,且pre-miR-137序列在所有鱼类中具有较高的保守性。对miR-137靶基因进行GO和KEGG分析,多个靶基因富集在色素沉积、色素细胞分化等信号通路。定量结果显示,锦鲤出膜后11 d(day post hatching, dph) miR-137-3p表达量达到最高,随后显著降低;miR-137-3p在锦鲤不同组织中均有表达,在眼和肌肉中表达量较高,在皮肤和鳍条等色素细胞存在的组织中也有较高表达,且白色组织表达量显著高于红色组织。荧光素酶实验结果显示,miR-137-3p可结合在mitfa 3′-UTR上并抑制其表达,但对sprb并无显著抑制作用;miR-137-3p与mitfa和sprb在不同发育阶段存在显著负相关,但在组织中不存在相关性。本研究发现,miR-137在鱼类进化过程中高度保守,与锦鲤体色形成具有一定的相关性,且可靶向调控mitfa参与体色的形成,以上结果为进一步探讨miR-137在锦鲤体色形成中的作用提供基础数据。
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| 关 键 词： | 锦鲤 miRNA-137 进化 表达 靶基因 体色 |
| 收稿时间： | 2020/10/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/12/7 0:00:00 |
Evolution, target genes certification and expression analysis of microRNA-137 in Japanese ornamental carp (Cyprinus carpio) |
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| LI Junru,MA Xiao,WU Limin,LIU Huifen,SHI Xi,SONG Hongmei,TIAN Xue and LI Xuejun.Evolution, target genes certification and expression analysis of microRNA-137 in Japanese ornamental carp (Cyprinus carpio)[J].Journal of Fisheries of China,2021,45(6):831-845. |
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| Authors: | LI Junru MA Xiao WU Limin LIU Huifen SHI Xi SONG Hongmei TIAN Xue and LI Xuejun |
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| Institution: | Engineering Technology Research Center of Henan Province for Aquatic Animal Cultivation, College of Fisheries, Henan Normal University, Xinxiang 453007, China;Key Laboratory of Recreational Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Pearl River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510380, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cyprinus carpio miRNA-137 evolution expression target gene body color |
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