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尼罗罗非鱼、萨罗罗非鱼及其杂交子代胰岛素样生长因子(IGF-Ⅰb)基因3′cDNA末端克隆及序列分析
引用本文:范武江,李思发,王兵,孟庆辉.尼罗罗非鱼、萨罗罗非鱼及其杂交子代胰岛素样生长因子(IGF-Ⅰb)基因3′cDNA末端克隆及序列分析[J].水产学报,2010,34(4):489-499.
作者姓名:范武江  李思发  王兵  孟庆辉
作者单位:上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室;
基金项目:罗非鱼产业技术体系(新D-8002-09-0055); 公益性行业(农业)科研专项:罗非鱼大规格鱼种规模化培育与生态养殖技术研究(nyhyzx07-044-01); 国家科技支撑计划专题:耐盐罗非鱼新品种选育(2006BAD01A1203)
摘    要:为探讨尼罗罗非鱼、萨罗罗非鱼及其杂交子代(Oreochromis niloticus ♀× Sarotherodon melanotheron ♂)IGF-Ⅰ基因结构差异,研究IGF-Ⅰ基因与此3种基因型罗非鱼耐盐性能差异之间的关系,通过3′-RACE的方法,从鳃的总RNA分别获得其IGF-Ⅰb基因的部分cDNA序列,长度分别为1076bp、1075bp和1079bp,包含完整的开放阅读框(ORF)546bp、一个终止密码及含polyA信号的3′UTR;ORF编码182个氨基酸,包括信号肽(44aa),成熟肽B区(29aa)、C区(10aa)、A区(21aa)、D区(8aa)及编码70aa的E区,二级结构为混合类型;与其他脊椎动物IGF-Ⅰb序列的序列相似度达75.8%~100%;成熟肽A、B区高度保守,C区第82位后缺失2aa,E区第131位和159位分别缺失3aa和1aa;萨罗罗非鱼在E133位发生Ala/Pro氨基酸残基替换,与耐盐性强的莫桑比克罗非鱼和画眉罗非鱼一致,推测IGF-Ⅰb基因E区选择性剪切与3种罗非鱼耐盐性能差异有关。

关 键 词:尼罗罗非鱼  萨罗罗非鱼  杂交子代  胰岛素样生长因子-Ⅰb  cDNA  克隆  
收稿时间:2009/9/27 0:00:00
修稿时间:2009/12/22 0:00:00
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