| 不同地理群体的鲇线粒体DNA 16S rRNA基因序列比较分析 |
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| 引用本文： | 王庆容,宋培,唐立俊,喻哓丹.不同地理群体的鲇线粒体DNA 16S rRNA基因序列比较分析[J].广东农业科学,2013,40(1):150-153. |
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| 作者姓名： | 王庆容 宋培 唐立俊 喻哓丹 |
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| 作者单位： | 遵义师范学院生物系,贵州遵义,563002 |
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| 基金项目： | 贵州省科技厅项目(黔科合J字2011-2189) |
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| 摘 要： | 对长江中上游主要支流5个野生群体鲇舞阳河群体(WYH)、乌江群体(WJ)、雅砻江群体(YLJ)、岷江群体(MJ)、金沙江群体(CS)]中的27个样品的16S rRNA基因进行PCR扩增,并对扩增产物测序.用CLUSTAL X v 1.81软件对所得的27个16SrRNA序列进行比对,并用Dna SP 5.10软件进行比较分析,共检测出74个变异位点、8种单倍型.舞阳河、乌江、雅砻江、岷江、金沙江等5个野生群体的单倍型多样性(H)分别为0.600、0.857、0.600、0.600、0.667,核苷酸多样性(π)分别为0.00072、0.1754、0.00036、0.00072、0.01871.对5个野生群体的16S rRNA序列进行Tajima's D和Fst分析发现,所有群体符合中性进化模型,且有一些单倍型的分化,只有金沙江群体的遗传差异显著.对5个群体进行分子变异等级分析的结果表明,群体间分子变异不显著.对5个群体构建分子系统树发现,乌江、雅砻江、岷江、金沙江群体之间的亲缘关系较近,舞阳河群体与其他群体间的亲缘关系较远.
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| 关 键 词： | 鲇 线粒体DNA 遗传多样性 16S rRNA基因 |
Comparison and analysis of the five wild Chinese catfish(Silurus asotus Linnaeus) populations based on mitochondrial DNA 16S rRNA sequences |
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| WANG Qing-rong
,
SONG Pei-yong
,
TANG Li-jun
,
YU Xiao-dan.Comparison and analysis of the five wild Chinese catfish(Silurus asotus Linnaeus) populations based on mitochondrial DNA 16S rRNA sequences[J].Guangdong Agricultural Sciences,2013,40(1):150-153. |
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| Authors: | WANG Qing-rong SONG Pei-yong TANG Li-jun YU Xiao-dan |
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| Institution: | (Department of Biology,Zunyi Normal College,Zunyi 563002,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Silurus asotus mitochondrial DNA genetic diversity 16S rRNA gene |
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