| 凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 杜江丽,张晓军,张小溪,袁剑波,高羿,李富花,相建海.凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析[J].水产学报,2019,43(4):771-781. |
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| 作者姓名： | 杜江丽 张晓军 张小溪 袁剑波 高羿 李富花 相建海 |
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| 作者单位： | 中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31672632，31702320，41876167） |
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| 摘 要： | E75是对虾蜕皮激素信号通路的关键调控因子。为了深入了解E75基因的结构和功能,本实验从转录组数据中筛选得到注释为凡纳滨对虾E75基因的转录本,经与基因组序列比对分析,鉴定发现凡纳滨对虾E75基因至少存在6种可变剪接体,分别命名为LvE75-1、LvE75-2、LvE75-3、LvE75-4、LvE75-5和LvE75-6。其中LvE75-1/2/4/5/6均包含DBD和LBD结构域,与果蝇E75A/C有相同的结构域,而LvE75-3仅包含LBD结构域,与果蝇E75D相同。在凡纳滨对虾蜕皮过程中,LvE75-1/2/3/4在D3～D4时期高表达,而LvE75-5和LvE75-6表达量很低。在成体组织中,LvE75各种剪切形式在所有检测的组织中均有表达,且在表皮、肠和鳃中表达较高,在肝胰脏、血细胞和淋巴组织中仅LvE75-3表达较高。实验通过双链RNA干扰LvE75基因的表达,在干扰样品中,检测到Halloween基因中的spo、phm和dib表达下调,shd表达上调,表明LvE75可能通过调控Halloween基因的表达来影响蜕皮激素的合成;同时E75基因的干扰也使同为蜕皮激素早期应答基因的Br-C基因和Ftz-F1基因表达下调,HR3基因表达上调,表明LvE75基因对蜕皮信号通路上下游基因均有作用。在LvE75基因持续干扰12 d后,凡纳滨对虾的蜕皮率显著低于对照组,而死亡率显著高于对照组,说明LvE75基因对凡纳滨对虾的蜕皮和生存具有重要作用。
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| 关 键 词： | 凡纳滨对虾 E75基因 蜕皮 可变剪接 RNA干扰 |
| 收稿时间： | 2018/1/8 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/6/24 0:00:00 |
Identification and analysis of alternatively spliced E75 gene inPacific white shrimp (Litopenaeus vannamei) |
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| DU Jiangli,ZHANG Xiaojun,ZHANG Xiaoxi,YUAN Jianbo,GAO Yi,LI Fuhua and XIANG Jianhai.Identification and analysis of alternatively spliced E75 gene inPacific white shrimp (Litopenaeus vannamei)[J].Journal of Fisheries of China,2019,43(4):771-781. |
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| Authors: | DU Jiangli ZHANG Xiaojun ZHANG Xiaoxi YUAN Jianbo GAO Yi LI Fuhua and XIANG Jianhai |
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| Institution: | Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory forMarine Science and Technology, Qingdao 266237, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory forMarine Science and Technology, Qingdao 266237, China,Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory forMarine Science and Technology, Qingdao 266237, China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China,Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory forMarine Science and Technology, Qingdao 266237, China,Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory forMarine Science and Technology, Qingdao 266237, China,Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory forMarine Science and Technology, Qingdao 266237, China and Key Laboratory of Experimental Marine Biology, Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Qingdao National Laboratory forMarine Science and Technology, Qingdao 266237, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Litopenaeus vannamei E75 gene molting alternatively splicing RNAi |
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