花生转录因子基因NAC4的等位变异分析 |
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引用本文: | 李文,万千,刘风珍,张昆,张秀荣,厉广辉,万勇善.花生转录因子基因NAC4的等位变异分析[J].作物学报,2015,41(1):31-41. |
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作者姓名: | 李文 万千 刘风珍 张昆 张秀荣 厉广辉 万勇善 |
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作者单位: | 山东农业大学农学院 / 作物生物学国家重点实验室 / 山东省作物生物学重点实验室,山东泰安 271018 |
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基金项目: | 山东省花生良种产业化工程项目;山东省现代农业产业技术体系花生创新团队建设项目(SDAIT-05-011-02);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-14);国家“十二五”科技支撑计划项目(2011BAD35B04);国家自然科学基金项目(31271757)资助 |
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摘 要: | NAC转录因子在植物应答非生物胁迫中起重要作用。利用生物信息学分析推测花生栽培种转录因子基因Ah NAC4(登录号为HM776131.1)属于抗旱相关转录因子基因,对比栽培品种山花11号Ah NAC4的2条c DNA序列(Shr NAC4-a和Shr NAC4-b)及其相应的DNA序列(Sh NAC4-a和Sh NAC4-b)表明,Ah NAC4全长为1244 bp,编码区长度为1050 bp,含有2个内含子,分别位于182~279 bp和547~642 bp处,编码蛋白包含349个氨基酸。从抗旱性不同的32个栽培品种分离得到4类Ah NAC4,分别命名为Ah NAC4-a1、Ah NAC4-a2、Ah NAC4-b1和Ah NAC4-b2,缩写为a1、a2、b1和b2。a1和a2为等位基因,二者在717 bp处存在1个碱基差异,引起第174位氨基酸的改变,b1和b2为等位基因,二者存在14个SNP位点,其中717 bp和924 bp处碱基的差异引起第174位和第244位氨基酸的改变。供试品种中基因型为a1a1b1b1、a1a1b2b2、a2a2b1b1、a2a2b2b2的品种数分别为10、5、15和2。从19个野生种中分离得到11类NAC4的DNA序列(Aw1NAC4–Aw11NAC4),Aw1NAC4与栽培种b1、b2的核苷酸序列同源性最高,Aw2NAC4与栽培种a1、a2核苷酸序列同源性最高。推测栽培种a1基因编码蛋白对花生抵御干旱起关键作用,a1和b1基因编码蛋白的功能与野生种更接近。
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关 键 词: | 花生 转录因子 NAC 等位变异 |
收稿时间: | 2014-04-16 |
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