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地鳖虫纤溶酶的三维结构模拟与序列分析
引用本文:余磊,韩雅莉.地鳖虫纤溶酶的三维结构模拟与序列分析[J].湖北农业科学,2014(5):1185-1188.
作者姓名:余磊  韩雅莉
作者单位:武汉软件工程职业学院;广东工业大学轻工与化工学院
基金项目:国家自然科学基金项目(30772739)
摘    要:为了研究地鳖虫(Eupolyphage sinensis Walker)纤溶酶的溶栓机理,根据地鳖虫纤溶酶成熟肽编码序列,利用生物信息学方法,对地鳖虫纤溶酶进行了结构分析,用Biosun软件的同源模建技术,模拟了其三维结构。利用GOLDKEY软件,对地鳖虫纤溶酶的氨基酸序列进行了分析,讨论了其等电点、亲水性、柔性与催化活性之间的关系。结果表明,地鳖虫纤溶酶的活性中心是组氨酸、丝氨酸和天冬氨酸3个氨基酸残基,位于球蛋白中心凹穴处,底物结合部位是丝氨酸、天冬氨酸和甘氨酸,该类酶水解纤维蛋白的机理是催化精氨酸-赖氨酸之间的肽键水解。

关 键 词:地鳖虫(Eupolyphage  sinensis  Walker)  纤溶酶  三维结构  序列
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