| 棉花GhFAD2-1基因5’UTR内含子的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 孙亮,文凤,刘峰,张新宇,孙杰.棉花GhFAD2-1基因5’UTR内含子的克隆与序列分析[J].新疆农业科学,2018(1). |
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| 作者姓名： | 孙亮 文凤 刘峰 张新宇 孙杰 |
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| 作者单位： | 石河子大学农学院; |
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| 摘 要： | 【目的】对棉花~(Δ12)-油酸去饱和酶基因Gh FAD2-1 5'UTR区的内含子进行克隆和序列分析,为研究Gh FAD2-1的表达调控奠定基础。【方法】利用5'RACE技术,克隆Gh FAD2-1的5'UTR序列,结合棉花基因组序列,克隆Gh FAD2-1 5'UTR内含子,并利用PLACE等生物信息学软件对其顺式作用原件进行分析。【结果】棉花A、D基因组的Gh FAD2-1 5'UTR中各含一内含子序列,全长分别为1 103 bp、1 111 bp;Gh FAD2-1成熟mRNA的5'UTR为77bp,转录的起点碱基为T;5'UTR内含子两个剪切位点分别AA-GG、CA-GC。该内含子包括一些典型的与光响应相关的作用元件,以及与激素和胁迫因素相关的应答元件等。【结论】克隆获得了棉花A、D基因组的Gh FAD2-1基因5'UTR内含子序列;明确其转录的起点碱基及5'UTR内含子的剪切位点,为进一步在分子水平上研究Gh FAD2-1功能及其表达调控规律,为植物的遗传改良奠定了基础。
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| 关 键 词： | 棉花 GhFAD2-1基因 5'UTR内含子 克隆 序列分析 |
Cloning and Sequence Analysis of 5'UTR Intron of GhFAD2-1 Gene from Cotton(Gossypium hirsutum L.) |
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