| 牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 赵姝君,;王敬姣,;王梦楠,;吴茜红,;李冬杰,;李世杰.牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析[J].广西农业生物科学,2014(3):505-510. |
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| 作者姓名： | 赵姝君 ;王敬姣 ;王梦楠 ;吴茜红 ;李冬杰 ;李世杰 |
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| 作者单位： | [1]河北农业大学生命科学学院,保定071001; [2]河北科技大学生物科学与工程学院,石家庄050018 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31372312）; 河北省自然基金项目（C2011204001）共同资助 |
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| 摘 要： | 在人、鼠和猪中,Phlda2基因是一个母源表达的印记基因,编码一种胞浆蛋白,具有与血小板同源的结构域。在牛中,Phlda2基因的结构和功能还不清楚。本研究首先利用RT-PCR方法对Phlda2基因在牛组织中的表达进行了分析,进而采用生物信息学方法对牛Phlda2基因的分子进化、启动子及蛋白的高级结构进行了分析和预测。结果表明,Phlda2基因在牛的心、肝、脾、肺、肾、大脑、骨骼肌、皮下脂肪、卵巢和胎盘10个组织中均有表达。对包括人、小鼠、牛、猪、原鸡、非洲爪蝉、斑马鱼和袋鼠在内的8种动物Phlda2基因mRNA序列进化进行分析,发现这8种动物的遗传距离小于0.435,且牛和猪遗传距离最近,为0.148,与基因系统进化树分析的结果一致。牛Phlda2基因的启动子最可能位于该基因起始密码子上游487-737bp区域,包括20种转录因子结合位点。牛Phlda2基因编码亲水性蛋白,其二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主;蛋白三级结构包括一个由β片层和α-螺旋构成的血小板同源结构域（PH）。以上研究结果将为进一步研究Phlda2基因的功能和分析基因表达调控的分子机理奠定基础。
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| 关 键 词： | 牛 Phlda2基因 生物信息学 组织表达 |
Tissue Expression and Bioinformatics Analysis of Bovine Phlda2 Gene |
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| Institution: | ZhaoShujun,Wang Jingjiao, Wang Mengnan, WuXihong, LiDongjie, LiShijie( 1 College of Life Science, Agricultural University of Hebei, Baoding, 071001; 2 College of Life Science and Technology, Hebei University, Shijiazhuang, 050018) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bovine Phlda2 gene Bioinformatic analysis Tissues expression |
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