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尘螨变应原Der f 6、Der p 6和Blo t 6结构的比较研究
引用本文:滕飞翔,俞黎黎,卞勇华,孙金霞,张承伯,王楠,杨李,崔玉宝.尘螨变应原Der f 6、Der p 6和Blo t 6结构的比较研究[J].广西农业生物科学,2014(4):761-767.
作者姓名:滕飞翔  俞黎黎  卞勇华  孙金霞  张承伯  王楠  杨李  崔玉宝
作者单位:盐城卫生职业技术学院医学检验学院,盐城224005
基金项目:国家自然科学基金面上项目(No.NSFC31272369)资助
摘    要:使用ProtParam、PROSITE、Jpred、Modeller 9.12和ABCpred等生物信息学工具来预测、比较分析尘螨变应原Der f6、Derp6和Blot6的理化性质、一级结构、二级结构、三级结构及抗原表位。Der f6、Der p6和Blo t 6氨基酸序列一致性为78.35%,都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列;二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成;活性位点氨基酸在三级结构中完全重合,并相互靠近构成蛋白酶的活性中心;主要潜在抗原表位区域为4~5个,并在第37~38 aa和第175~179 aa区域出现了重合,但表位重合区的氨基酸种类不完全相同。本研究应用生物信息方法预测和比较了Der f6、Der p 6和Blot6结构与抗原方面的信息,为进一步研究变应原功能、疫苗研制奠定了基础。

关 键 词:尘螨  变应原  结构  抗原表位
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