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鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析
引用本文:闵霞,贾智英,李池陶,李飞,石连玉.鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析[J].安徽农业大学学报,2012,39(2):195-200.
作者姓名:闵霞  贾智英  李池陶  李飞  石连玉
作者单位:中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,哈尔滨150070;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,哈尔滨,150070
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46-02);黑龙江省自然科学基金(C201044);公益性行业(农业)科研专项(200903045);黑龙江水产研究所基本科研业务费专项资金(201005);国家高技术研究发展计划(2011AA100402)共同资助
摘    要:根据已克隆的鲤鱼MHC Ⅱ B基因序列,设计1对特异性引物,采用PCR-SSCP方法对6个鲤鱼群体MHC Ⅱ B基因第3外显子108 bp扩增片段进行多态性分析,结果共获得7种基因型(A-G),其中基因型为B型的个体数占所有群体总个体数的47.45%,且分布于所有群体,其它6种基因型出现频率范围为1.1%~17.15%。回收不同基因型的片段并测序,经比对共发现4个碱基多态位点和3个氨基酸多态位点。易捕鲤和大头鲤两群体中各发现4个突变位点(占3.7%);松荷鲤、松浦鲤和德国镜鲤群体各发现3个突变位点(占2.7%);松浦镜鲤群体仅发现2个突变位点(占1.8%)。用Popgene软件计算每个群体不同位点的杂合度和多态信息含量(PIC),6个鲤鱼群体的观测杂合度(Ho)最大值为0.746 4,最小值为0.103 7;多态信息含量为0.062 3~0.360 9。该研究将为今后深入研究鲤鱼MHC基因多态性及与鲤鱼抗病新品种的选育提供理论依据。

关 键 词:MHC  鲤鱼  多态性  多态核苷酸位点  连锁不平衡
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