4株猪流行性腹泻病毒S蛋白序列特征和遗传进化分析 |
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引用本文: | 蔡青秀,夏业才.4株猪流行性腹泻病毒S蛋白序列特征和遗传进化分析[J].中国兽药杂志,2015,49(7):1-7. |
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作者姓名: | 蔡青秀 夏业才 |
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作者单位: | 中国兽医药品监察所,中国兽医药品监察所 |
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基金项目: | 科技部科技基础性工作专项—重大动物疫病病原及相关制品标准物质的研究(2008FY130100) |
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摘 要: | 为了解目前国内猪流行性腹泻病毒流行毒株与疫苗毒株的S蛋白差异情况,从2013年采自北京、河南、陕西、广东四个省市的疑似猪流行性腹泻病料中抽提RNA,用设计的针对结构基因S的特异性引物进行RT-PCR扩增、克隆及测序,并对其序列变化、遗传进化情况和抗原位点进行分析。结果显示:4个样品株的S基因(4161 bp)与国内疫苗株CV777(4152 bp)相比,存在15个核苷酸的插入和6个核苷酸的缺失,导致推导的氨基酸序列存在5个氨基酸的插入(~(59)QGVN~(62)and~(140)N)和2个氨基酸的缺失(~(163)NI~(164)),且在主要突变区S1区的2个中和表位(499~638aa和764~771aa)有7处氨基酸突变。遗传进化分析结果显示,4个样品株与主要疫苗株同源性较低(93.8%~94.7%),而与2007~2009年韩国毒株、2011年日本毒株以及中国近年流行毒株同源性高(96.0%~99.6%),表明近年来国内猪流行性腹泻病毒呈现较大变异,可能需要研制更有效的疫苗用于猪流行性腹泻的防控。
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关 键 词: | 猪流行性腹泻病毒 结构基因S 序列特征 遗传进化分析 |
收稿时间: | 4/3/2015 12:00:00 AM |
修稿时间: | 2015/5/31 0:00:00 |
Sequence Characteristics and Genetic Analysis of S Protein of 4 Porcine Epidemic Diarrhea Strains |
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Institution: | China Institute of Veterinary Drug Control, |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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