| 橡胶HMGR蛋白的生物信息学分析与同源模建 |
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| 引用本文： | 吴春太,李维国,高新生,张晓飞.橡胶HMGR蛋白的生物信息学分析与同源模建[J].热带作物学报,2009,29(10). |
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| 作者姓名： | 吴春太 李维国 高新生 张晓飞 |
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| 作者单位： | 中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心 海南儋州 571737;中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心 海南儋州 571737;中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心 海南儋州 571737;中国热带农业科学院橡胶研究所/国家橡胶树育种中心 海南儋州 571737 |
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| 摘 要： | 利用生物信息学方法分析了橡胶HMGR蛋白的氨基酸组成、等电点、疏水/亲水区、二级结构等蛋白质性质，并同荔枝、拟南芥和水稻的蛋白进行了对比，并用生物信息学软件对其空间结构进行了模拟，同时对模建结果进行了结构质量的分析与检测。结果表明：该蛋白共有575个氨基酸，等电点为6.44，二级结构中α螺旋占45.91%，β折叠片占13.04%，无规卷曲占35.83%。三维结构检测表明，此模型的结构符合立体化学规则。此外，利用该模型预测了配体SIM和ADP在HMGR结构空间的近似位置，并定位了与SIM和ADP作用的相关残基。
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| 关 键 词： | 橡胶 HMGR蛋白 生物信息学 同源模建 |
Bioinformatics Analysis and Homology Modeling of HMGR Protein from Hevea brasiliensis |
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| Institution: | Rubber Research Institute/State Center for Rubber Tree Breeding, CATAS, Danzhou, Hainan 571737;Rubber Research Institute/State Center for Rubber Tree Breeding, CATAS, Danzhou, Hainan 571737;Rubber Research Institute/State Center for Rubber Tree Breeding, CATAS, Danzhou, Hainan 571737;Rubber Research Institute/State Center for Rubber Tree Breeding, CATAS, Danzhou, Hainan 571737 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hevea brasiliensis HMGR protein bioinformatics homology modeling |
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