| 青天葵1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因片段的鉴定和分析 |
| |
| 引用本文： | 黄琼林,何瑞,詹若挺.青天葵1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因片段的鉴定和分析[J].北方园艺,2015(22). |
| |
| 作者姓名： | 黄琼林 何瑞 詹若挺 |
| |
| 作者单位： | 广东医学院,广东湛江,524023;广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心,岭南中药资源教育部重点实验室,广东广州510006 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金;广东省自然科学基金;广东医学院博士学位人员科研启动基金 |
| |
| 摘 要： | 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是植物萜类MEP生物合成途径的第一个限速关键酶,提高其编码基因的表达可提高植物萜类化合物的含量。该研究在青天葵全转录组测序数据中获取青天葵DXS基因片段序列,利用生物信息学方法对其系统发育进化、保守功能域、理化性质、亲/疏水性、跨膜结构域、信号肽等进行分析和预测,并采用RPKM法分析其在青天葵叶片和球茎的表达量,为后期利用DXS基因调控青天葵萜类成分的生物合成提供理论依据。结果表明:NfDXS基因片段序列长度为2 154bp,编码含有718个氨基酸、分子量约为77.45kDa的亲水性蛋白,与其它DXS同源性可达80%。NfDXS具有1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶功能域,没有信号肽和跨膜结构域,二级结构表现为混合型结构蛋白质。NfDXS基因在青天葵中的表达趋势为:叶片球茎。
|
| 关 键 词： | 青天葵 1-脱氧-D-木酮糖-5磷酸合成酶 生物信息学 表达量 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
