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斑马鱼il-11b基因5'端启动子序列及体外活性分析
引用本文:丁安,张秋月,张哲,徐行,岳倩文,任建峰,李伟明,张庆华.斑马鱼il-11b基因5''端启动子序列及体外活性分析[J].上海海洋大学学报,2021,30(4):581-589.
作者姓名:丁安  张秋月  张哲  徐行  岳倩文  任建峰  李伟明  张庆华
作者单位:上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学,上海海洋大学
基金项目:教育部留学回国人员科研启动基金(D-8002-15-0042),上海市教委重点创新项目(13ZZ-127);
摘    要:白细胞介素11(Interleukin-11,IL-11)是白细胞介素家族的重要成员,其在伤口愈合、癌细胞迁移及免疫调控等过程中起到关键作用。为了深入研究IL-11的转录调控机制,本实验通过生物信息学分析,找出斑马鱼il-11b基因的3000bp启动子序列,经缺失处理获得2908bp、2000bp、1000bp和500bp不同片段,进行PCR扩增并与pGL3-enhancer载体重组构建pGL3-il-11b-promoter-enhancer 报告基因质粒,接着转染HEK293T 细胞,再用双荧光素酶报告基因检测系统检验其转录活性。结果显示所获的il-11b启动子序列上存在3个潜在的启动子区和7个CpG岛,潜在的转录因子结合位点包括Sp1、CACCC-binding f、Egr-1、ICSBP、c-Jun、COUP、GR、RAP1、NF-kappaB、REV-ErbA alpha、ER、RAR-alpha1、RXR-beta、SRF、Oct-1、Oct-2、Pit-1a、GCN4、HNF-1、TBP、C/EBP alpha、HNF-1C、Oct-2.1、USF等,成功扩增出il-11b不同片段启动子,重组质粒双酶切检测条带大小一致,测序比对正确,双荧光素酶检测pGL3-il-11b、pGL3-il-11b-Δ1、pGL3-il-11b-Δ2、pGL3-il-11b-Δ3、pGL3-il-11b-Δ4、pGL3-il-11b-Δ5报告基因质粒的活性分别是pGL3–enhancer空载对照组的1.94、14.92、5.33、9.11、0.75、1.32倍。该结果为研究细胞因子参与的免疫相关信号之间的调控提供了有力的研究工具。

关 键 词:斑马鱼  il-11b  启动子  报告基因
收稿时间:2019/11/1 0:00:00
修稿时间:2020/8/27 0:00:00

Sequence analysis of 5' upstream promoter of il-11b gene in zebrafish and construction of reporter gene vectors
DING An,ZHANG Qiuyue,ZHANG Zhe,XU Xing,YUE Qianwen,REN Jianfeng,LI Weiming,ZHANG Qinghua.Sequence analysis of 5'' upstream promoter of il-11b gene in zebrafish and construction of reporter gene vectors[J].Journal of Shanghai Ocean University,2021,30(4):581-589.
Authors:DING An  ZHANG Qiuyue  ZHANG Zhe  XU Xing  YUE Qianwen  REN Jianfeng  LI Weiming  ZHANG Qinghua
Institution:Shanghai Ocean Univercity,Shanghai Ocean Univercity,Shanghai Ocean Univercity,Shanghai Ocean Univercity,Shanghai Ocean Univercity,Shanghai Ocean Univercity,Shanghai Ocean Univercity,Shanghai Ocean Univercity
Abstract:
Keywords:zebrafish  il-11b  promoter  report gene
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