鸡MDA5的序列分析与结构域预测 |
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引用本文: | 庄海彬,李伟强,黄小武,叶芷羽,丘林峰,林宏文,宋亚婷,丁仰保,黄鉴妮,焦培荣.鸡MDA5的序列分析与结构域预测[J].中国家禽,2023(6):36-42. |
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作者姓名: | 庄海彬 李伟强 黄小武 叶芷羽 丘林峰 林宏文 宋亚婷 丁仰保 黄鉴妮 焦培荣 |
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作者单位: | 1. 华南农业大学兽医学院,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室;2. 柳州市动物疫病预防控制中心;3. 通辽市扎鲁特旗动物疫病预防控制中心;4. 广西大学动物科学技术学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32072844、31872497);;国家重点研发计划项目(2021YFD1800202); |
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摘 要: | 为了解鸡黑色素瘤分化相关基因-5(Melanoma differentiation-associated protein 5,MDA5)的序列和结构域,试验使用PCR方法扩增了鸡MDA5基因并构建真核表达质粒,实现了鸡MDA5蛋白的真核表达,同时利用MegAlign等软件对鸡MDA5氨基酸序列进行分析。结果显示:鸡MDA5全长3 006 bp,编码1 001个氨基酸;鸡MDA5与人、猕猴、野猪、小鼠、绿头鸭、灰雁、鸿雁、鲫鱼、草鱼的氨基酸相似性分别为62.4%、62.9%、62.7%、64.1%、86.8%、87.3%、87.4%、48.1%、46.3%;鸡MDA5与鸟类进化关系较近,与哺乳动物次之,与鱼类进化关系较远;鸡MDA5由N端两个半胱天冬酶激活招募结构域、DExD/H box RNA解旋酶结构域和C端结构域组成;鸡MDA5二级结构包含α螺旋(50.95%)、延伸链(11.19%)、β转角(3.9%)和无规则卷曲(33.97%),三级结构与人MDA5类似,在空间上呈现半闭合环状结构。研究成功鉴定了鸡MDA5基因,分析了其基因序列并预测其结构域,为深入研究鸡MDA5结构与功能及其...
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关 键 词: | 鸡黑色素瘤分化相关基因-5 基因克隆 序列分析 结构域预测 |
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