| 猪眼肌面积的全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 杨凯,张瑞琪,卢倬达,李克标,郭猛,朱晓萍,赵云翔.猪眼肌面积的全基因组关联分析[J].黑龙江畜牧兽医,2023(23):41-46+133. |
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| 作者姓名： | 杨凯 张瑞琪 卢倬达 李克标 郭猛 朱晓萍 赵云翔 |
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| 作者单位： | 1. 佛山科学技术学院生命科学与工程学院;2. 广西扬翔股份有限公司 |
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| 基金项目： | 广东省重点领域研发计划项目(2022B0202090002)； |
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| 摘 要： | 为了研究杜洛克猪和杜长大猪校正115 kg眼肌面积(corrected loin eye area at 115 kg)的遗传参数及相关的候选基因，试验收集2 783头杜洛克猪和2 424头杜长大猪的LEA115数据，使用Gene Seek GGP 50K芯片对杜洛克猪与杜长大猪进行基因分型。对杜洛克猪的基因型数据进行质量控制，去除个体基因型检出率<0.95的样品，去除单核苷酸多态性(single-nucleotide pdymorphism, SNP)基因型检出率<0.99、最小等位基因频率<0.05、哈代-温伯格平衡检验P值<1×10-6的SNP位点；对杜长大猪不进行哈代-温伯格平衡检验，其余质量控制条件同杜洛克猪。利用ASReml软件对杜洛克猪与杜长大猪的LEA115进行遗传参数估计，使用rMVP软件包提供的FarmCPU(fixed and random model circulating probability unification)模型对杜洛克猪与杜长大猪的LEA115进行全基因组关联分析(genome-wide associ...
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| 关 键 词： | 杜洛克猪 杜长大猪 眼肌面积 全基因组关联分析(GWAS) 候选基因 |
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