| 2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒S1、M和ORF3基因遗传进化分析 |
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| 引用本文： | 熊谋康,梁太润,刘献辉,王志朋,王爽云,刘燕玲,张乐宜,宋长绪.2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒S1、M和ORF3基因遗传进化分析[J].黑龙江畜牧兽医,2023(15):8-17. |
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| 作者姓名： | 熊谋康 梁太润 刘献辉 王志朋 王爽云 刘燕玲 张乐宜 宋长绪 |
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| 作者单位： | 华南农业大学国家生猪种业工程技术研究中心/动物科学学院 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2021YFD1801205)； |
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| 摘 要： | 为了解2020—2021年我国部分地区猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株变异及遗传进化情况，试验从多个地区的51家猪场采集340份疑似感染PEDV的猪小肠组织、粪便和肛拭子，提取病毒核酸后采用RT-PCR方法扩增S1、M和ORF3基因并测序，与GenBank中PEDV参考毒株进行比对分析，利用生物信息学软件构建遗传进化树，分析核苷酸序列同源性及氨基酸序列。结果表明：共获得57份PEDV阳性样品，来源于14家猪场，猪场阳性率为27.5%,并对从阳性猪场获得的14株毒株进行命名。与经典毒株CV777相比，14株PEDV毒株的S1、M和ORF3基因均出现不同程度的氨基酸突变。在14株毒株的S1基因中，Heyuan2021-7毒株位于G1-2分支，其余13株位于G2分支，14株毒株与参考毒株GD-A核苷酸序列的相似性较高，为89.3%～99.9%,存在多处氨基酸的缺失和插入。在M基因中，14株毒株位于G2分支且与参考毒株FR-001核苷酸序列的相似性为98.1%～99.7%,只存在氨基酸突变。在ORF3基因中，FC2021-1、GD...
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒(PEDV) 检测 S1基因 M基因 ORF3基因 基因测序 遗传变异 |
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