麦鱼线粒体基因组序列测定与结构特征分析 |
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引用本文: | 鲍鸣,奚业文,海思娆,王晨龙,陈闯将,王希春,李西雷.麦鱼线粒体基因组序列测定与结构特征分析[J].河北渔业,2023(9):20-27+47. |
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作者姓名: | 鲍鸣 奚业文 海思娆 王晨龙 陈闯将 王希春 李西雷 |
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作者单位: | 1. 安徽省水产技术推广总站;2. 安徽农业大学动物科技学院 |
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摘 要: | 通过PCR扩增和一代测序技术获得麦鱼(Rhinogobius sp.)线粒体基因组全序列,并对其序列结构进行了分析。结果表明:1)麦鱼线粒体基因组全长16 511 bp,其碱基G+C的含量为47.7%,A+T的含量为52.3%,呈现AT偏好性;2)共含有蛋白质编码基因13个,rRNA基因2个,tRNA基因22个和D-loop区,除ND6、tRNA-Gln、tRNA-Tyr、tRNA-Ala、tRNA-Asn、tRNA-Cys、tRNA-Ser、tRNA-Glu、tRNA-Pro基因在L链上编码之外,其他基因均在H链上进行编码;3)基于线粒体基因组全序列和Cytb基因,分别构建了鰕虎鱼类中部分属的进化树,其表明麦鱼与波氏吻鰕虎鱼、褐吻鰕虎鱼、子陵吻鰕虎鱼聚在一个分支上,均属于吻鰕虎鱼属,并且其与波氏吻鰕虎鱼的亲缘关系最近。
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关 键 词: | 麦鱼(Rhinogobius sp.) 线粒体基因组 序列分析 系统发育进化 物种鉴定 |
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