| 猪心肌和骨骼肌miRNA转录组比较分析 |
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| 引用本文： | 谭 娅,马继登,刘一辉,等.猪心肌和骨骼肌miRNA转录组比较分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2015,43(8):19-26. |
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| 作者姓名： | 谭 娅 马继登 刘一辉 等 |
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| 作者单位： | 四川农业大学 动物遗传育种与繁殖研究所,四川农业大学 动物遗传育种与繁殖研究所,四川农业大学 动物遗传育种与繁殖研究所 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划（“863”计划）项目（2013AA102502）；国家转基因生物新品种培育重大专项（2014ZX0800950B，2011ZX08006-003）；教育部长江学者和创新团队发展计划项目（IRT13083） |
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| 摘 要： | 【目的】研究microRNA(miRNA)在猪不同类型肌肉生长发育中的作用。【方法】以猪心肌以及2种骨骼肌(背最长肌和腰大肌)为材料,采用Illumina高通量测序技术鉴定其miRNA转录组,并进行差异表达分析和靶基因富集分析。【结果】从猪心肌、背最长肌和腰大肌组织的3个小RNA测序文库中共获得约56M的序列,通过生物信息分析共鉴定出907个非冗余miRNA,其中441个miRNA在3个文库共同表达,123个miRNA在文库间表现为显著的差异表达(P10-6)。对3个文库差异表达miRNA的相关性分析发现,背最长肌与腰大肌的相关性最高(r=0.94),证明2种骨骼肌的表达模式十分相近,而心肌与2种骨骼肌的表达模式不同。通过对各文库高表达的miRNA分析发现,表达量前十的miRNA中有6个miRNA的表达量在心肌中极显著上调。对在心肌内上调的6个miRNA进行的靶基因预测和生物学功能预测发现,这些差异miRNA主要靶向作用于钙信号通路和胰岛素信号通路。荧光定量PCR(qRT-PCR)验证结果表明高通量测序结果准确可靠。【结论】从miRNA层面揭示了猪心肌和骨骼肌的差异,这种差异在一定程度上印证了心肌和骨骼肌之间迥异的生理学特征。
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| 关 键 词： | microRNA 心肌 骨骼肌 高通量测序 猪 |
| 收稿时间： | 2014/1/27 0:00:00 |
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